Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GCCTATTATGCTCCTGGAGCCACTCCTCCTCCCTTTTTTGCCACAACCGTTGCTTCCCCAACTCCCCATCCCTATTTATGGGGAGGCCAGgtaaatgtagtaaatcatttaggataatatatgctattatactttatagaagtgaatcgtcttatttacaattttgttaatttttccag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA16G25600.2
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|7924295|gb|AW830321.1|AW830321
EST:     TTCCCCAACTCCCCATCCCTATTTATGGGGAGGCCAG                         CATCCTTTGATGCCGCCATATGGGACTCCAGTCCCATATCCAGCTATATAT
genomic: TTCCCCAACTCCCCATCCCTATTTATGGGGAGGCCAGgtaaatgtag ... atttttccagCATCCTTTGATGCCGCCATATGGGACTCCAGTCCCATATCCAGCTATATAT
EST: gi|298165829|gb|HO008800.1|HO008800
EST:     CCACAACCGTTGCTTCCCCAACTCCCCATCCCTATTTATGGGGAGGCCAG                         CATCCTTTGATGCCGCCATATGGGACTCCAGTCCCGTATCCAGCTATATAT
genomic: CCACAACCGTTGCTTCCCCAACTCCCCATCCCTATTTATGGGGAGGCCAGgtaaatgtag ... atttttccagCATCCTTTGATGCCGCCATATGGGACTCCAGTCCCATATCCAGCTATATAT