1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
GTTCTCCTTTGGGAACTAGCCAGAACATTGCATCTCTGTGCCGGCAGCAATAAGCTTGGAAGCTTTGCTAGATCCTTGCTATTTGGCATCCCTCCTTCAgttggcaacttcattccttctttacaaatttaaattaatttgttatttgttcttgtgaaaggaatagtaaatacaaggaaaatatatttcaataaaaaatgaccacatggaaaagttgaataatatttcttctgtcatgctcttaagaacttaataactgtctcttatgcag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA16G20030.1 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: ATAAGCTTGGAAGCTTTGCTAGATCCTTGCTATTTGGCATCCCTCCTTCA GTCCCTGGTTTAAGTTTATCGCTTGCTGATACTGGGTATGCATGTGTTTCTEST: gi|192326576|gb|FK018478.1|FK018478
genomic: ATAAGCTTGGAAGCTTTGCTAGATCCTTGCTATTTGGCATCCCTCCTTCAgttggcaact ... tcttatgcagGTCCCTGGTTTAAGTTTATCGCTTGCTGATACTGGGTATGCATGTGTTTCT
EST: ATAAGCTTGGAAGCTTTGCTAGATCCTTGCTATTTGGCATCCCTCCTTCA GTCCCTGGTTTAAGTTTATCGCTTGCTGATACTGGGTATGCATGTGTTTCTEST: gi|208067956|gb|GD861466.1|GD861466
genomic: ATAAGCTTGGAAGCTTTGCTAGATCCTTGCTATTTGGCATCCCTCCTTCAgttggcaact ... tcttatgcagGTCCCTGGTTTAAGTTTATCGCTTGCTGATACTGGGTATGCATGTGTTTCT
EST: ATAAGCTTGGAAGCTTTGCTAGATCCTTGCTATTTGGCATCCCTCCTTCA GTCCCTGGTTTAAGTTTATCGCTTGCTGATACTGGGTATGCATGTGTTTCEST: gi|208234179|gb|GE033222.1|GE033222
genomic: ATAAGCTTGGAAGCTTTGCTAGATCCTTGCTATTTGGCATCCCTCCTTCAgttggcaact ... tcttatgcagGTCCCTGGTTTAAGTTTATCGCTTGCTGATACTGGGTATGCATGTGTTTC
EST: ATAAGCTTGGAAGCTTTGCTAGATCCTTGCTATTTGGCATCCCTCCTTCA GTCCCTGGTTTAAGTTTATCGCTTGCTGATACTGGGTATGCATGTGTTTC
genomic: ATAAGCTTGGAAGCTTTGCTAGATCCTTGCTATTTGGCATCCCTCCTTCAgttggcaact ... tcttatgcagGTCCCTGGTTTAAGTTTATCGCTTGCTGATACTGGGTATGCATGTGTTTC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GTTCTCCTTTGGGAACTAGCCAGAACATTGCATCTCTGTGCCGGCAGCAATAAGCTTGGAAGCTTTGCTAGATCCTTGCTATTTGGCATCCCTCCTTCAgttggcaacttcattccttctttacaaatttaaattaatttgttatttgttcttgtgaaaggaatagtaaatacaaggaaaatatatttcaataaaaaatgaccacatggaaaagttgaataatatttcttctgtcatgctcttaagaacttaataactgtctcttatgcag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAAG