Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

AAAGAATCGTTCTTTGGAGAGTCTGCAGGCCAATGTGCAGAGGCTCAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaaattcttcaatcattaatttgatgattatgtgcaaattttatttattttatggtcatcattaccttgtaagtagtaaacattgaagtttgagattgtttacatccctaattttgctttgcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA16G17370.1
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA16G17370.2 (Glycine max), 5'ss of exon 3
lower sequence: LOC_Os06g02510.3 (Oryza sativa), 5'ss of exon 4
AAAGAATCGTTCTTTGGAGAGTCTGCAGGCCAATGTGCAGAGGCTCAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaaattcttcaatcattaatttgatgattatgtgcaaatttt---atttattttatggtcatcattaccttgtaagtagtaaacattgaagtttgagattgtttacatccctaattttgctttgcag
 ||||| || ||  | ||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| | ||  | ||||||||| | || | |||||||||||| | |   || | | |   | |||   | |   |||    ||   ||    |  |   |||   | | ||   ||||    | ||                                                
TAAGAACCGCTCACTTGAAGGTCTGCAGGCCAATGTCCAGAGGCTGAAGACCTACAAGGCCAAGCTTGTCATCTTCCCAAGACGTGCCCGCAAGGTCAAGgtgagg--gaactttacccgccttagccttacacttaaacccactgttctgaagatcccttacattaaccaactcctttc--gcag------------------------------------------------

upper sequence: GLYMA16G17370.2 (Glycine max), 5'ss of exon 3
lower sequence: LOC_Os03g37970.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 4
AAAGAATCGTTCTTTGGAGAGTCTGCAGGCCAATGTGCAGAGGCTCAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaaattcttcaatcattaatttgatgattatgtgcaaattttatttattttatggtcatca-ttaccttgtaagtagtaaacattgaagtttgagattgtttacatccctaattttgctttgcag
 ||||| || ||  | ||| | || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||| | ||||||||  | || | |||||||||||||  |||  | | |    || || | |   ||  ||| |    |||  |  || | |  ||| || |  |   ||||      |   ||                                          
CAAGAACCGCTCACTTGAGGGACTCCAGGCTAATGTCCAGAGGCTCAAGACATACAAGGCCAAGCTGGTTATCTTCCCAAGGCGTGCTCGCAAGGTCAAGgtatggctgcagtttgttgtcctttactccttg--tatatagttattgaaggtactatcaggttatgagcttgattgtgctcttttgtcag-----------------------------------------

upper sequence: GLYMA16G17370.2 (Glycine max), 5'ss of exon 3
lower sequence: GRMZM2G145280_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 4
AAAGAATCGTTCTTTGGAGAGTCTGCAGGCCAATGTGCAGAGGCTCAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgta-aagctaaattcttcaatcattaatttgatgattatgtgcaaattttatttattttatggtcatcattaccttgtaagtagtaaacattgaagtttgagattgtttacatccctaattttgctttgcag
 |||||    ||  | ||| | |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||| ||||| | ||||||||  | ||||||||||| ||||||   ||   | ||||   || ||| |   |  |||  || |  || |||  |  ||   |  |   | |  ||| | |        ||||| ||                                    
CAAGAACAAATCCCTTGAGGGACTGCAGGCCAATGTCCAGAGGCTTAAGACATACAAGGCCAAGCTGGTTATCTTCCCAAGGCGTGCACACAAGGTTAAGgtatgggcagcaatcttt--tccttagtgaaagcatt--gttcttatcttagctgcttc--gacctctaatctcttatcacctactttcattgcag------------------------------------

upper sequence: GLYMA16G17370.2 (Glycine max), 5'ss of exon 3
lower sequence: GRMZM2G145280_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 4
------AAAGAATCGTTCTTTGGAGAGTCTGCAGGCCAATGTGCAGAGGCTCAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgta-aagctaaattcttcaatcattaatttgatgattatgtgcaaattttatttattttatggtcatcattaccttgtaagtagtaaacattgaagtttgagattgtttacatccctaattttgctttgcag
       |||||    ||  | ||| | |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||| ||||| | ||||||||  | ||||||||||| ||||||   ||   | ||||   || ||| |   |  |||  || |  || |||  |  ||   |  |   | |  ||| | |        ||||| ||                                    
CCGCCGCAAGAACAAATCCCTTGAGGGACTGCAGGCCAATGTCCAGAGGCTTAAGACATACAAGGCCAAGCTGGTTATCTTCCCAAGGCGTGCACACAAGgttaaggtatgggcagcaatcttt--tccttagtgaaagcatt--gttcttatcttagctgcttc--gacctctaatctcttatcacctactttcattgcag------------------------------------

upper sequence: GLYMA16G17370.2 (Glycine max), 5'ss of exon 3
lower sequence: GRMZM2G081102_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 4
AAAGAATCGTTCTTTGGAGAGTCTGCAGGCCAATGTGCAGAGGCTCAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaaattcttcaatcattaatttgatgattatgtgcaaattttatttattttatggtcatcattaccttgtaagtagtaaacattgaagtttgagattgtttacatccctaattttgctttgcag
 |||||    ||  | ||| | |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||| ||||| | ||||||||  | || | |||||||||||||    ||   || ||  |   | |     | | ||| |    |    |||   | | |||      | | ||   ||    | | ||   |  ||||     |                          
CAAGAACAAATCCCTTGAGGGGCTGCAGGCCAATGTCCAGAGGCTTAAGACATACAAGGCCAAGCTGGTTATCTTCCCAAGGCGTGCTCGCAAGGTCAAGgtatgagtag--tcatcttttcctgaacaattaagtatctcttgaaggcattg--tctctggctgctttgatctcaaaatcccttatcacctacttttgttgcag--------------------------

upper sequence: GLYMA16G17370.2 (Glycine max), 5'ss of exon 3
lower sequence: GRMZM2G409407_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 4
AAAGAATCGTTCTTTGGAGAGTCTGCAGGCCAATGTGCAGAGGCTCAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagct--aaattcttcaatcattaatttgatgatt--atgtgcaaattttatttattttatggtcatcattaccttgtaagtagtaaacattgaagtttgagattgtttacatccctaattttgctttgcag
 |||||    ||| | ||| | |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||| ||||| | ||||||||  | || | ||||| ||| |||    |  |||| |||   | | |   |||    ||  |   ||   | ||    |  |  ||||  |  ||  ||| |||    |        |  ||  |    |                          
CAAGAACAAATCTCTCGAGGGACTGCAGGCCAATGTCCAGAGGCTTAAGACGTACAAGGCCAAGCTGGTTATCTTCCCAAGGCGTGCTCGCAAGGCCAATgtatgtgtagaaatactttcctgaatgccttgtcccttgaagacgcctctcttgaagacatgctggttgtt-ttgacttctaatcccttgtggcctaccttcaatgcag--------------------------

upper sequence: GLYMA16G17370.2 (Glycine max), 5'ss of exon 3
lower sequence: AT5G23900.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 4
AAAGAATCGTTCTTTGGAGAGTCTGCAGGCCAATGTGCAGAGGCTCAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaaattcttcaatcattaatttgatgattatgtgcaa---attttatttattttatggtcatcattaccttgtaagtagtaaacattgaagtttgagattgtttacatccctaattttgctttgcag
 ||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||| || ||| | || || ||||||||||||||||| ||||||||  |  |  | |   | |||||||||     ||    || |    ||| || ||  | ||| |   |   |   | || ||| |   ||  |  |||   |   | |  |  |  ||    ||| ||                              
CAAGAACCGTTCTTTGGAGGGTCTTCAGTCCAATGTCCAAAGGTTAAAGACTTACAAGGCTAAGTTGGTGGTGTTCCCTCGCCGTTCCCGTCAAGTCAAGgta---tcaatcatttgagatcttagttagagtagtatatttgagacaccctcttgattcttgagttcttgtta---taacaattttgtatcttttgttttcag------------------------------

upper sequence: GLYMA16G17370.2 (Glycine max), 5'ss of exon 3
lower sequence: AT3G48960.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 3
AAAGAATCGTTCTTTGGAGAGTCTGCAGGCCAATGTGCAGAGGCTCAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaaattcttcaatcattaatttgatgattatgtgcaaattttatttattttatggtcat---cattaccttgtaagtagtaaacattgaagtttgagattgtttacatccctaattttgctttgcag
 ||||| || ||||||||| || | ||  |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||  |  | || |  | ||||||||||   |    |||   |   | |  |||   | | |   |   | | |||  ||   ||||   |    || | ||  |   |  ||  | ||   ||||| | ||                           
CAAGAACCGGTCTTTGGAGGGTTTTCAAACCAACGTCCAGAGGCTGAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTTATCTTCCCGCGCTGTGCCCGAACGGTCAAGgtactcc----ttcgcaagcaactggtttagggttca---gtggactgtatgaatggaatggatttggatatgatctctttgttgttatgctttt--gtttgtgtttag-------------------------

upper sequence: GLYMA16G17370.2 (Glycine max), 5'ss of exon 3
lower sequence: PP1S126_52V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 4
AAAGAATCGTTCTTTGGAGAGTCTGCAGGCCAATGTGCAGAGGCTCAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaaattcttcaatcattaatttgatgattatgtgc----aaattttatttattttatggtcatcattaccttgtaagtagtaaacattgaagtttgagattgtttacatccctaattttgctttgcag
 |||||||| |  |||||||| || || |  || ||  |  | || || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |  || | |||  |||||||    | |  |||    || |   ||||||  |||| |||    |||  |  |  |  | | | || | |  | | |     | || || || ||| | |                                 
TAAGAATCGGTGCTTGGAGAGCCTTCAAGAGAACGTTAACCGTCTTAACACCTACAGGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCTAGACGCTCAAAGAAGACCAAGgtatgcgtgacatctctcttc-tagttttgatttttatctgctatgaaacatcgtcgaagtgaagatcgtga--aacataagttttgttaaaat-gaaatatac-------------------------------

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|151397233|gb|EV267106.1|EV267106
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|192333345|gb|FK024322.1|FK024322
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|208054633|gb|GD850612.1|GD850612
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|58014663|gb|CX701405.1|CX701405
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|254339157|gb|GR847874.1|GR847874
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|18040171|gb|BM308465.1|BM308465
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|192325267|gb|FK019138.1|FK019138
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAAAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|58022991|gb|CX709732.1|CX709732
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|298169024|gb|HO020384.1|HO020384
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGGGCTGGCAAATGCCACTCAAGTC
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTC
EST: gi|209714772|gb|BW674284.1|BW674284
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAGTGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|17963610|gb|BM270357.1|BM270357
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|209719490|gb|BW650995.1|BW650995
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|298186766|gb|HO037399.1|HO037399
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAGGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTC
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTC
EST: gi|298188828|gb|HO035521.1|HO035521
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCCGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTC
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTC
EST: gi|26047262|gb|CA784114.1|CA784114
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|192307547|gb|FK002051.1|FK002051
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|120529623|gb|EH257757.1|EH257757
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|192307548|gb|FK002052.1|FK002052
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|208165075|gb|GD965779.1|GD965779
EST:     ACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: ACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|208110520|gb|GD913124.1|GD913124
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|254339156|gb|GR847873.1|GR847873
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|192311235|gb|FK003412.1|FK003412
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGATGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|10255394|gb|BE823160.1|BE823160
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|7639316|gb|AW733641.1|AW733641
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|192294416|gb|FG987345.1|FG987345
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|298189992|gb|HO032113.1|HO032113
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGT
EST: gi|20207618|gb|BQ133707.1|BQ133707
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|17400476|gb|BM177258.1|BM177258
EST:     CTACAAGGCTNAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CTACAAGGCT-AAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|208188475|gb|GD984741.1|GD984741
EST:     GCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: GCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|12688119|gb|BG154455.1|BG154455
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTACAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|5688362|gb|AI941377.1|AI941377
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|26045674|gb|CA783182.1|CA783182
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|192333344|gb|FK024321.1|FK024321
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|16279452|gb|BI943444.1|BI943444
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|298174537|gb|HO017760.1|HO017760
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGT
EST: gi|214009133|gb|DB990013.1|DB990013
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|192326227|gb|FK017004.1|FK017004
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|192322731|gb|FK014422.1|FK014422
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGACAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|298164179|gb|HO013824.1|HO013824
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCGCTCAAGTC
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTC
EST: gi|12773229|gb|BG238156.1|BG238156
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|192307238|gb|FK002344.1|FK002344
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGCTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|5605849|gb|AI899947.1|AI899947
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|298170562|gb|HO019186.1|HO019186
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCA
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCA
EST: gi|207789687|gb|GD763429.1|GD763429
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|298183645|gb|HO028858.1|HO028858
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTC
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTC
EST: gi|17963368|gb|BM270118.1|BM270118
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|17021978|gb|BM093012.1|BM093012
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|23726992|gb|BU761509.1|BU761509
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCT
EST: gi|151403844|gb|EV273654.1|EV273654
EST:     CAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|298199481|gb|HO042844.1|HO042844
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTC
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTC
EST: gi|192297294|gb|FG990628.1|FG990628
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACGAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|298184300|gb|HO029513.1|HO029513
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGG
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGG
EST: gi|16348456|gb|BI974051.1|BI974051
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|6915365|gb|AW396895.1|AW396895
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|31459383|gb|CD401411.1|CD401411
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|13240430|gb|BG359739.1|BG359739
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTATCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|298185009|gb|HO030222.1|HO030222
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTA
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTA
EST: gi|298190321|gb|HO032442.1|HO032442
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTC
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTC
EST: gi|298171485|gb|HO016517.1|HO016517
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCAC
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCAC
EST: gi|120529625|gb|EH257759.1|EH257759
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|208069895|gb|GD867940.1|GD867940
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|213589451|gb|DB973187.1|DB973187
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|254338648|gb|GR849959.1|GR849959
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|298198943|gb|HO042306.1|HO042306
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTC
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTC
EST: gi|193562396|gb|FK518185.1|FK518185
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATG
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTA-GCCTTGAAGAGCTGGCAAATG
EST: gi|213614672|gb|DB980594.1|DB980594
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|193567522|gb|FK524237.1|FK524237
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAGGAGCTGG
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGG
EST: gi|58020636|gb|CX707378.1|CX707378
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|4396034|gb|AI495031.1|AI495031
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|9204549|gb|BE330773.1|BE330773
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCATGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|298194867|gb|HO043339.1|HO043339
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCT
EST: gi|18711944|gb|BM522620.1|BM522620
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|298184392|gb|HO029605.1|HO029605
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGCTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTC
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTC
EST: gi|209714773|gb|BW674285.1|BW674285
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAGTGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|208175833|gb|GD977242.1|GD977242
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTC
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTC
EST: gi|298168564|gb|HO009494.1|HO009494
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTC
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTC
EST: gi|151410932|gb|EV280747.1|EV280747
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|298189983|gb|HO032104.1|HO032104
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTC
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTC
EST: gi|17964134|gb|BM270874.1|BM270874
EST:     GGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: GGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|208135724|gb|GD936681.1|GD936681
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGG
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGG
EST: gi|213608840|gb|DB962878.1|DB962878
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|151402405|gb|EV272218.1|EV272218
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|23729091|gb|BU762630.1|BU762630
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|14990725|gb|BI316398.1|BI316398
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|209713135|gb|BW653844.1|BW653844
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|19346399|gb|BM891279.1|BM891279
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|17963591|gb|BM270338.1|BM270338
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGG
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGG
EST: gi|298175316|gb|HO015975.1|HO015975
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGT
EST: gi|298187819|gb|HO031776.1|HO031776
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCT
EST: gi|209718665|gb|BW662731.1|BW662731
EST:     GAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: GAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
EST: gi|298164253|gb|HO013898.1|HO013898
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGA
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGA
EST: gi|21888595|gb|BQ741808.1|BQ741808
EST:     CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAG                         GCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT
genomic: CCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaa ... tgctttgcagGCTGGTGATTCTAGCCTTGAAGAGCTGGCAAATGCCACTCAAGTCCAGGGT

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
AAAGAATCGTTCTTTGGAGAGTCTGCAGGCCAATGTGCAGAGGCTCAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTTGTGTTCCCAAGAAGGGCACACAAGGTCAAGgtaaagctaaattcttcaatcattaatttgatgattatgtgcaaattttatttattttatggtcatcattaccttgtaagtagtaaacattgaagtttgagattgtttacatccctaattttgctttgcag

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAAG