Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GGTCCTCTTCCAATTTGAAGCTAGCGAGGATGGACAAGTCCAGTTCTTTCCAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAATgtatagacactagcttttgttcttgtgggttcattgttaggcgttttatgtgatgactgatgatgatgtttgtttgtttatcgattttcgtaacag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA14G02500.1
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|10234213|gb|BE803101.1|BE803101
EST:     CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAAT                         GTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTNTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG
genomic: CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAATgtatagacac ... ttcgtaacagGTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG
EST: gi|18040453|gb|BM308747.1|BM308747
EST:     CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAAT                         GTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG
genomic: CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAATgtatagacac ... ttcgtaacagGTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG
EST: gi|11413203|gb|BF425214.1|BF425214
EST:     AAATGCTGCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTTGT-GCCATCAAT                         GTTAGTCCTATTGAGTATGGGCATGATATGCTGATT
genomic: AAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTT-GTTGCCATCAATgtatagacac ... ttcgtaacagGTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATT
EST: gi|19346233|gb|BM891113.1|BM891113
EST:     CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAAT                         GTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG
genomic: CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAATgtatagacac ... ttcgtaacagGTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG
EST: gi|6071672|gb|AW101059.1|AW101059
EST:     AAATGCTCCCAGT-GATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAAT                         GTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG
genomic: AAATGCTCC-AGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAATgtatagacac ... ttcgtaacagGTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG
EST: gi|19452462|gb|BM953872.1|BM953872
EST:     CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAAT                         GTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG
genomic: CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAATgtatagacac ... ttcgtaacagGTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG
EST: gi|208178799|gb|GD979606.1|GD979606
EST:     CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAAT                         GTCAGTCCTATTAGAAGTATGGGCAT
genomic: CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAATgtatagacac ... ttcgtaacagGTCAGTCCTATT-GA-GTATGGGCAT
EST: gi|13789523|gb|BG652114.1|BG652114
EST:     CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAAT                         GTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG
genomic: CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAATgtatagacac ... ttcgtaacagGTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG
EST: gi|11687442|gb|BF595118.1|BF595118
EST:     TTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAAT                         GTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATTTTCTAG
genomic: TTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAATgtatagacac ... ttcgtaacagGTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG
EST: gi|9205432|gb|BE331656.1|BE331656
EST:     CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAAT                         GTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG
genomic: CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAATgtatagacac ... ttcgtaacagGTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG
EST: gi|21994685|gb|BQ786213.1|BQ786213
EST:     GTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAAT                         GTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG
genomic: GTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAATgtatagacac ... ttcgtaacagGTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG
EST: gi|19346232|gb|BM891112.1|BM891112
EST:     CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAAT                         GTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG
genomic: CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAATgtatagacac ... ttcgtaacagGTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG
EST: gi|151406689|gb|EV276504.1|EV276504
EST:     CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAAT                         GTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG
genomic: CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAATgtatagacac ... ttcgtaacagGTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG
EST: gi|7686123|gb|AW756771.1|AW756771
EST:     CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAAT                         GTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG
genomic: CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAATgtatagacac ... ttcgtaacagGTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG
EST: gi|9203876|gb|BE330100.1|BE330100
EST:     CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAAT                         GTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG
genomic: CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAATgtatagacac ... ttcgtaacagGTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG
EST: gi|10234196|gb|BE803084.1|BE803084
EST:     CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAAT                         GTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTNTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG
genomic: CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAATgtatagacac ... ttcgtaacagGTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATTTTCGAG