Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ATATCTGCTAGCATTGCCGGCGATTTAGTTCTTGCTACAGCATATTCACATGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgttcatgaggaattccttcctctcccaccctcgtctcactcagttttttttaaactcttgtctcatgttttaatatctgtgtccag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA13G35590.1
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA13G35580.2 (Glycine max), 5'ss of exon 4
lower sequence: GRMZM2G163081_T04 (Zea mays), 5'ss of exon 4
----ATATCTGCTAGCATTGCCGGCGATTTAGTTCTTGCTACAGCATATTCACATGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgttcatgagga--attccttcctctcccaccctcgtct----cactcagttttttttaaactcttgtctcatgttttaatatctgtgtccag
    ||||||||||| || || || ||| | ||||||||| | || || || |||||| |||||||||||||||||||||| || || || || |||||||| |||  | | | ||||   |  ||   |   |  |  |   |  | |     | | |  | || |  || ||    | ||| || ||              
AATCATATCTGCTAGTATAGCGGGTGATATGGTTCTTGCTTCTGCCTACTCGCATGAGTTGCCACGATATGGTCTTGAAGTTGGTCTGACCAACTATGCAgctggtattttttccatggaaataatgtataaattgcatattatattttaatgtatttatatattctctaaatcaacacccatcttgtag-------------

upper sequence: GLYMA13G35580.2 (Glycine max), 5'ss of exon 4
lower sequence: GRMZM2G163081_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 4
ATATCTGCTAGCATTGCCGGCGATTTAGTTCTTGCTACAGCATATTCACATGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgttcatg--aggaattccttcctctcccaccctcgtct----cactcagttttttttaaactcttgtctcatgttttaatatctgtgtccag
||||||||||| || || || ||| | ||||||||| | || || || |||||| |||||||||||||||||||||| || || || || |||||||| |||  | | | ||||  |  |||   |   |  |  |   |  | |     | | |  | || |  || ||    | ||| || ||              
ATATCTGCTAGTATAGCGGGTGATATGGTTCTTGCTTCTGCCTACTCGCATGAGTTGCCACGATATGGTCTTGAAGTTGGTCTGACCAACTATGCAGCTGgtattttttccatggaaataatgtataaattgcatattatattttaatgtatttatatattctctaaatcaacacccatcttgtag-------------

upper sequence: GLYMA13G35580.2 (Glycine max), 5'ss of exon 4
lower sequence: GRMZM5G815894_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 4
ATATCTGCTAGCATTGCCGGCGATTTAGTTCTTGCTACAGCATATTCACATGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtg--ctgtgttcatgaggaattccttcctctcccaccctcgtctcactcagttttttttaaactcttgtctcatgttttaatatctgtgtccag
|| |||||||| || || || ||| | ||||||||| | || || || |||||| |||||||||||||||||||||| || || || || |||||||| |||    |   |||  ||   |||   |    | |         || | | | ||| | | |  | || ||   |    |||   ||    |  ||
ATCTCTGCTAGTATAGCAGGTGATATGGTTCTTGCTTCTGCTTACTCGCATGAGTTGCCACGATATGGTCTTGAAGTTGGTCTGACCAACTATGCAGCTGgtaatttcccttctggaaatattgtgtaaattgcatattgtaccttaatgaatttatat-attcactagttcaactgcttacactcatcttgtag

upper sequence: GLYMA13G35580.2 (Glycine max), 5'ss of exon 4
lower sequence: GRMZM2G090738_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 4
ATATCTGCTAGCATTGCCGGCGATTTAGTTCTTGCTACAGCATATTCACATGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgc---tgtgttcatgaggaattccttcctctcccaccctcgtctcactcagttttttttaaactcttgtctcatgttttaatatctgtgtccag
 ||||||| || ||  | || ||| |  |||||||| | |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| || || || || ||||| ||||||     | |||     | ||||   |   |   | |   |       | || | | ||||  | |  |  ||| | |    | ||||   || ||
GTATCTGCAAGTATCACGGGTGATATTATTCTTGCTGCTGCATATTCCCGTGAGCTGCCACGATACGGTCTAGAAGTTGGTCTGACCAACTATGCTGCAGgtatatttatgtctgcaaagaatg--taaattgtctattgttactaagcaca-tatattttgtattgctaactcct-tgcccacatct---tctag

upper sequence: GLYMA13G35580.2 (Glycine max), 5'ss of exon 4
lower sequence: Vv00s0174g00190.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 5
ATATCTGCTAGCATTGCCGGCGATTTAGTTCTTGCTACAGCATATTCACATGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgttcatgaggaattccttcctctcccaccctcgtctcactcagttttttttaaactcttgtctcatgttttaatatctgtgtccag
||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||  | || ||||| ||||| ||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||  | | || |      |||  |   | || |   ||  | |     ||| || |     ||  | ||    |  |                
ATATCTGCTAGTATTGCTGGTGATATGGTTCTTGCAGCGGCCTATTCCCATGAACTGCCTCACTATGGGCTTGAAGTGGGTCTTACAAATTACGCGGCAGgta-tatatttactctccattagtctatatcaccttct-atatgtggaagtattctcactgcttctatcatgagcatag--------------

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|298179265|gb|HO027736.1|HO027736
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|13181447|gb|BG352787.1|BG352787
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAT                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|298175002|gb|HO017997.1|HO017997
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTCGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|26058921|gb|CA801835.1|CA801835
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|42722709|gb|CK768608.1|CK768608
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|37993992|gb|CF805738.1|CF805738
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|298185668|gb|HO030881.1|HO030881
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|209721139|gb|BW665696.1|BW665696
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|213588681|gb|DB957689.1|DB957689
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAGAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|213593969|gb|DB961913.1|DB961913
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|15203735|gb|BI426503.1|BI426503
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|37993873|gb|CF805619.1|CF805619
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|19452678|gb|BM954088.1|BM954088
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|6502066|gb|AW203439.1|AW203439
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|213611688|gb|DB969076.1|DB969076
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|17153260|gb|BM143193.1|BM143193
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACTTTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|7326863|gb|AW620661.1|AW620661
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|15812318|gb|BI784593.1|BI784593
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|8282845|gb|BE020406.1|BE020406
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|192305243|gb|FG993981.1|FG993981
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|7590367|gb|AW706121.1|AW706121
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|209711827|gb|BW674087.1|BW674087
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|9900404|gb|BE609372.1|BE609372
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|213608827|gb|DB957191.1|DB957191
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|23727797|gb|BU761934.1|BU761934
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|18733428|gb|BM527602.1|BM527602
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|254328305|gb|GR835270.1|GR835270
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|298195414|gb|HO039245.1|HO039245
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|6072796|gb|AW102183.1|AW102183
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|254332683|gb|GR844053.1|GR844053
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|163921337|gb|EH039759.1|EH039759
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|298177039|gb|HO023400.1|HO023400
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|19269197|gb|BM885453.1|BM885453
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|213619435|gb|DB963401.1|DB963401
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|20498035|gb|BQ272965.1|BQ272965
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|46492910|gb|CN472466.1|CN472466
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|8284697|gb|BE022239.1|BE022239
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|23731241|gb|BU763733.1|BU763733
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|13562903|gb|BG551123.1|BG551123
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGACTAGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|14125882|gb|BG790320.1|BG790320
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|4286000|gb|AI440984.1|AI440984
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|192318939|gb|FK006835.1|FK006835
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|38192978|gb|CF922184.1|CF922184
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|11412751|gb|BF424762.1|BF424762
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|213607717|gb|DB958736.1|DB958736
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|209710634|gb|BW671006.1|BW671006
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|7326861|gb|AW620659.1|AW620659
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|18692881|gb|BM521729.1|BM521729
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|9440322|gb|BE440829.1|BE440829
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|15812394|gb|BI784669.1|BI784669
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|254316214|gb|GR827751.1|GR827751
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|298183188|gb|HO028451.1|HO028451
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|48575154|gb|CO036261.1|CO036261
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|17022274|gb|BM093308.1|BM093308
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|18040880|gb|BM309174.1|BM309174
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|208298056|gb|GE091031.1|GE091031
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|12773942|gb|BG238869.1|BG238869
EST:     GAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACCAATTATGCCA-CAN                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTTCTCAAAACACTTGAA
genomic: GAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGC-AGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAA
EST: gi|213614228|gb|DB956812.1|DB956812
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|24205594|gb|BU964847.1|BU964847
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|193626317|gb|FK572681.1|FK572681
EST:     CTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: CTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|213619814|gb|DB969478.1|DB969478
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|18041137|gb|BM309431.1|BM309431
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|209716540|gb|BW653902.1|BW653902
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|298183179|gb|HO028442.1|HO028442
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|213601355|gb|DB956675.1|DB956675
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|298183338|gb|HO028551.1|HO028551
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|254320081|gb|GR830997.1|GR830997
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|209710047|gb|BW681039.1|BW681039
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|254319372|gb|GR828992.1|GR828992
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|6070850|gb|AW100237.1|AW100237
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCANAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|298185362|gb|HO030575.1|HO030575
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|213617258|gb|DB972896.1|DB972896
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|208340211|gb|GE135787.1|GE135787
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACATATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTTTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|7590322|gb|AW706077.1|AW706077
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: gi|26267787|gb|CA818850.1|CA818850
EST:     TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG                         CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
ATATCTGCTAGCATTGCCGGCGATTTAGTTCTTGCTACAGCATATTCACATGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgttcatgaggaattccttcctctcccaccctcgtctcactcagttttttttaaactcttgtctcatgttttaatatctgtgtccag

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGAAG