Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TTCTATTAAGCAAATTCATTCCTACATGGGAGCTGAAGAGGGAGAAGATATTCCAGATATGGCAGAGTTTGACGATACTTCCAATGTTGAAAATGATCCTgtaagttgataccacattgttggaagtggggtttctgtttcctaactgtcctacatcaatttcagacttgatgtttaacttttattgaatcagacgaagg...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA12G00830.1
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|192330860|gb|FK021619.1|FK021619
EST:     TTCCAGATATGGCAGAGTTTGACGATACTTCCAATGTTGAAAATGATCCT                         GCCACTCTTCAGTCCACATATCTAGTTGCTCATGAACCTGATGACGATAAT
genomic: TTCCAGATATGGCAGAGTTTGACGATACTTCCAATGTTGAAAATGATCCTgtaagttgat ... gctaatggagGCCACTCTTCAGTCCACATATCTAGTTGCTCATGAACCTGATGACGATAAT
EST: gi|16104976|gb|BI892716.1|BI892716
EST:     TTCCAGATATGGCAGAGTTTGACGATACTTCCAATGTTGAAAATGATCCT                         GCCACTCTTCAGTCCACATATCTAGTTGCTCATGAACCTGATGACGATAAT
genomic: TTCCAGATATGGCAGAGTTTGACGATACTTCCAATGTTGAAAATGATCCTgtaagttgat ... gctaatggagGCCACTCTTCAGTCCACATATCTAGTTGCTCATGAACCTGATGACGATAAT
EST: gi|151395552|gb|EV265429.1|EV265429
EST:     TTCCAGATATGGCAGAGTTTGACGATACTTCCAATGTTGAAAATGATCCT                         ACCACTCTTCAGTCCACATATCTAGTTGCTCATGAACCTGATGACGATAAT
genomic: TTCCAGATATGGCAGAGTTTGACGATACTTCCAATGTTGAAAATGATCCTgtaagttgat ... gctaatggagGCCACTCTTCAGTCCACATATCTAGTTGCTCATGAACCTGATGACGATAAT
EST: gi|192324977|gb|FK016133.1|FK016133
EST:     TTCCAGATATGGCAGAGTTTGACGATACTTCCAATGTTGAAAATGATCCT                         GCCACTCTTCAGTCCACATATCTAGTTGCTTATGAACCTGATGACGATAAT
genomic: TTCCAGATATGGCAGAGTTTGACGATACTTCCAATGTTGAAAATGATCCTgtaagttgat ... gctaatggagGCCACTCTTCAGTCCACATATCTAGTTGCTCATGAACCTGATGACGATAAT
EST: gi|151404711|gb|EV274525.1|EV274525
EST:     TTCCAGATATGGCAGAGTTTGACGATACTTCCAATGTTGAAAATGATCCT                         -----TC--CA--C-A--TATCTAGTTGCTCATGAACCTGATGACGATAAT
genomic: TTCCAGATATGGCAGAGTTTGACGATACTTCCAATGTTGAAAATGATCCTgtaagttgat ... gctaatggagGCCACTCTTCAGTCCACATATCTAGTTGCTCATGAACCTGATGACGATAAT