1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
TGCCCAGAAAAGTTGCCAAATTATGAGCAGAAAATCAAAAGCTTCTTTGAAGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaactaattttctgctttactttgattttcttgccaccttgcctaccatgttaagttgctaaatatatcctgtttgtctttag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA10G38940.2 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|254329556|gb|GR839109.1|GR839109
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|120493118|gb|EH221285.1|EH221285
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|192318386|gb|FK006506.1|FK006506
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTTAEST: gi|22525694|gb|BU084505.1|BU084505
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTTATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|19270789|gb|BM887045.1|BM887045
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|6724539|gb|AW308938.1|AW308938
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|120497213|gb|EH225380.1|EH225380
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|9819664|gb|BE555177.1|BE555177
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATNTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|120496037|gb|EH224204.1|EH224204
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|13482036|gb|BG511379.1|BG511379
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|192318385|gb|FK006505.1|FK006505
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTTAEST: gi|15813895|gb|BI786170.1|BI786170
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|22522682|gb|BU081493.1|BU081493
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: ATAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|14258511|gb|BG881419.1|BG881419
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|8826939|gb|BE210669.1|BE210669
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GCTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGEST: gi|13252055|gb|BG362958.1|BG362958
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTG
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|254315800|gb|GR825609.1|GR825609
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: GAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|208122931|gb|GD923665.1|GD923665
genomic: GAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTT-GTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGEST: gi|213604889|gb|DB960570.1|DB960570
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCG
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|13481853|gb|BG511196.1|BG511196
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|6501990|gb|AW203363.1|AW203363
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|298186912|gb|HO034011.1|HO034011
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTCGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|254315801|gb|GR825610.1|GR825610
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|120493016|gb|EH221183.1|EH221183
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|7591166|gb|AW706904.1|AW706904
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|298174446|gb|HO014591.1|HO014591
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|163920707|gb|EH039976.1|EH039976
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|22525807|gb|BU084618.1|BU084618
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTTATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|7042440|gb|AW472334.1|AW472334
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|7041921|gb|AW471815.1|AW471815
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|298167016|gb|HO010455.1|HO010455
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|9902326|gb|BE611294.1|BE611294
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTATTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATCGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|120492922|gb|EH221089.1|EH221089
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|10844547|gb|BF067878.1|BF067878
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|192309293|gb|FK000501.1|FK000501
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|27426192|gb|CA937712.1|CA937712
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|298170925|gb|HO015901.1|HO015901
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|254339056|gb|GR847773.1|GR847773
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|207839806|gb|GD810895.1|GD810895
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: GAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTTAGGGEST: gi|6847682|gb|AW349972.1|AW349972
genomic: GAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTT-GTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTT-AGGG
EST: ACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCNTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|298194017|gb|HO040665.1|HO040665
genomic: ACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|298198070|gb|HO039609.1|HO039609
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|21600963|gb|BQ611294.1|BQ611294
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|120495258|gb|EH223425.1|EH223425
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTNTGGGTCAEST: gi|120492749|gb|EH220916.1|EH220916
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|207798267|gb|GD769503.1|GD769503
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGTTGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|298184067|gb|HO029280.1|HO029280
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCCTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|15285900|gb|BI469791.1|BI469791
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|192295836|gb|FG992632.1|FG992632
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: GATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|192302276|gb|FG997300.1|FG997300
genomic: GATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|6725583|gb|AW309982.1|AW309982
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|13312690|gb|BG406341.1|BG406341
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|192295835|gb|FG992631.1|FG992631
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: GAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG AGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|7283509|gb|AW596116.1|AW596116
genomic: GAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTNTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|254315760|gb|GR825569.1|GR825569
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGA-GAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|6746685|gb|AW317203.1|AW317203
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGCAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|31461994|gb|CD404022.1|CD404022
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|254315759|gb|GR825568.1|GR825568
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|254330215|gb|GR839768.1|GR839768
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|6455203|gb|AW185886.1|AW185886
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCTAGTGTGGGTCAEST: gi|192302524|gb|FG994832.1|FG994832
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|193433224|gb|FK393916.1|FK393916
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|4437017|gb|AI522882.1|AI522882
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG NGTATTNTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|208195023|gb|GD992128.1|GD992128
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTEST: gi|254330214|gb|GR839767.1|GR839767
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATT
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|120497212|gb|EH225379.1|EH225379
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|22525778|gb|BU084589.1|BU084589
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTTATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|23726129|gb|BU761046.1|BU761046
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCAEST: gi|11273900|gb|BF324289.1|BF324289
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGGTATTT-GATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCEST: gi|8282521|gb|BE020012.1|BE020012
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGG-TATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTC
EST: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTG GGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
genomic: AGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaacta ... ttgtctttagGGTATTTTGATGTTAGGGATTGCAATGATGCTTGGATTCGAGTGTGGGTCA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TGCCCAGAAAAGTTGCCAAATTATGAGCAGAAAATCAAAAGCTTCTTTGAAGAACATCTTCACACTGATGAGGAGATCCGCTTTTGTGCTGCTGGAAGTGgtacaaactaattttctgctttactttgattttcttgccaccttgcctaccatgttaagttgctaaatatatcctgtttgtctttag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGGAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGATC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAAG