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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

AGACTTGCAAGGGAATAAACTAACTGGGCAAATCCCTGATGAAATTGGAAACTGTGCAGCACTTGTTCATCTgtaagactctagccttatactatttactacttgatgttctagtcttgatcggagggttttgttcctatgacataagtgcttatcagttgtcacattttttcgtggatttgtag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA10G38730.1
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA10G38730.1 (Glycine max), 5'ss of exon 4
lower sequence: AT5G62230.2 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 4
AGACTTGCAAGGGAATAAACTAACTGGGCAAATCCCTGATGAAATTGGAAACTGTGCAGCACTTGTTCATCTgtaagactc--tagccttatactatttactacttgatgttctagtcttgatcggagggttttgt-tcctatgacataagtgcttatcagttgtcacattttttcgtggatttgtag
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AGACTTGCAAGGTAATAAACTAGCAGGTCAAATTCCAGATGAGATTGGAAACTGTGCTTCTCTTGTTTATCTgtaagtcttattaaacttgtttttttgagttttcaattttcatgtctttagttttgacgtccatatcctctgttgtacag------------------------------------