1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
GGCCTGCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGCGAGgtttgttctgcagaagggacttgggtttgaagtttgtgatattggggtgttgctttgtgtgatggttttggttgtttggtttgagcag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA10G26890.1 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGCGAG GTCATTGTGAGTGGAAAATTGAGAGCCCAGAGAGCCAAATCTATGAAGTTTEST: gi|298195932|gb|HO044323.1|HO044323
genomic: GCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGCGAGgtttgttctg ... gtttgagcagGTCATTGTGAGTGGAAAATTGAGAGCCCAGAGAGCCAAATCTATGAAGTTT
EST: GCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGCGAG GTCATTGTGAGTGGAAAATTGAGAGCCCAGAGAGCCAAATCTATGAAGTTTEST: gi|21256892|gb|BQ453780.1|BQ453780
genomic: GCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGCGAGgtttgttctg ... gtttgagcagGTCATTGTGAGTGGAAAATTGAGAGCCCAGAGAGCCAAATCTATGAAGTTT
EST: GCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGCGAG GTCATTGTGAGTGGAAAATTGAGAGCCCAGAGAGCCAAATCTATGAAGTTTEST: gi|6726858|gb|AW311277.1|AW311277
genomic: GCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGCGAGgtttgttctg ... gtttgagcagGTCATTGTGAGTGGAAAATTGAGAGCCCAGAGAGCCAAATCTATGAAGTTT
EST: GCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGCGAG GTCATTGTGAGTGGAAAATTGAGAGCCCAGAGAGCCAAATCTATGAAGTTTEST: gi|6725216|gb|AW309615.1|AW309615
genomic: GCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGCGAGgtttgttctg ... gtttgagcagGTCATTGTGAGTGGAAAATTGAGAGCCCAGAGAGCCAAATCTATGAAGTTT
EST: GCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGCGAG GTCATTGTGAGTGGAAAATTGAGAGCCCAGAGAGCCAAATCTATGAAGTTT
genomic: GCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGCGAGgtttgttctg ... gtttgagcagGTCATTGTGAGTGGAAAATTGAGAGCCCAGAGAGCCAAATCTATGAAGTTT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GGCCTGCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGCGAGgtttgttctgcagaagggacttgggtttgaagtttgtgatattggggtgttgctttgtgtgatggttttggttgtttggtttgagcag
- - - - - - - - - - - - - - TGGAGA