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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ATTCTTCAAGAAGAAATTGGGGGTGTGAAAGGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctctgttcttcacctcccttttgttttgcttcatgacatacttttattcaatgaaaccttccgttcgttggagaaattgacaaccatgcttat...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA09G36870.1
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA09G36870.1 (Glycine max), 5'ss of exon 4
lower sequence: LOC_Os05g16660.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 6
ATTCTTCAAGAAGAAATTGGGGGTGTGAAAGGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctctgttcttcacctcccttttgttttgcttca-tgacatacttttattcaatga--aaccttccgttcgttggagaaattgacaaccatgcttat---
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ATTTTGCAAGAGGAAATTGGTGGTGTAAAAGGCCATTTTGGACCAATTAACGCACTGGCATTTAATCCTGATGGACGGAGgtaa------tattcttaatacatgtgtaatattatatgaatgctatatttatgttctaccaccgcacttatgttctcgattagctttttgtttcatattactttg

upper sequence: GLYMA09G36870.1 (Glycine max), 5'ss of exon 4
lower sequence: LOC_Os08g21660.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 6
ATTCTTCAAGAAGAAATTGGGGGTGTGAAAGGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgta-tgttctctgttcttcacctcccttttgttttgcttcatgacatacttttattcaatgaaaccttccgttcgttggagaaattgacaacca-tgcttat
||| | ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||    ||||| | ||||   | | |    |    |||   ||    |    ||    | |  |  || |    || |     || | |   ||      || || ||  
ATTTTGCAAGAGGAAATTGGTGGTGTTAAAGGCCATTTTGGACCAATTAACGCGCTGGCATTTAATCCTGATGGGCGGAGgtaatattcttaatacatgtatttgtatttacgttctgcccctgcacttatgttcttgattagctttttcccatatttgtgtgctttttgctcaatgatt--

upper sequence: GLYMA09G36870.1 (Glycine max), 5'ss of exon 4
lower sequence: GRMZM2G143330_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 6
ATTCTTCAAGAAGAAATTGGGGGTGTGAAAGGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctctgttcttcacctcccttttgttttgcttcatgac--atacttttattcaatgaaaccttccgttcgttggagaaattgacaaccatgcttat
||| | ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    |||||  || | |  |||     |   | |   |||   ||||      || | |||  || |  | |      ||      | |   ||       ||  || 
ATTTTGCAAGAGGAAATTGGTGGTGTTAAAGGGCATTTTGGGCCAATTAATGCTTTGGCATTTAATCCTGATGGGCGGAGgtaatttttttaatctgacagtggttgtctctttcagtcatagttggtagtattaa-cagttgaccaggttattgcccatatatgctgtttttattgtata-

upper sequence: GLYMA09G36870.1 (Glycine max), 5'ss of exon 4
lower sequence: GRMZM2G028834_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 6
ATTCTTCAAGAAGAAATTGGGGGTGTGAAAGGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgta-tgttctctgttcttcacctcccttttgttttgct-tcatgaca--tacttttattcaatgaaaccttccgttcgttggagaaattgacaaccatgcttat
||| | ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    ||||| |  | | | || ||   ||    ||| |||||   |||| |    || ||| |||  || ||   ||     | |   |     | |     ||||    
ATTTTGCAAGAGGAAATTGGTGGTGTTAAAGGACATTTTGGGCCAATTAATGCTTTGGCATTTAATCCTGATGGGCGGAGgtaataattttttttatttgactgtggttttttttgtagtcattattgttagtttcattgtatcaacatttggccacttaacattgtctaaaggttatgc----

upper sequence: GLYMA09G36870.1 (Glycine max), 5'ss of exon 4
lower sequence: AT2G46280.3 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 6
ATTCTTCAAGAAGAAATTGGGGGTGTGAAAGGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctctgttcttcacctcccttttgttttgct--tcatgacatacttttattc--aatgaaaccttccgttcgttggagaaattgacaaccatgcttat-----
||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || |||||  ||  |     ||    |    ||  ||       || | ||||  |    ||   | ||     ||  | ||  |     | ||       |||  |||     
ATTCTGCAAGAGGAAATTGGTGGTGTGAAAGGTCATTTTGGACCTATAAATGCTTTGGCATTCAATCCTGATGGGAAGAGgtaaattaacaacatttggattttgattgattgacacaatcctcacatgatgaggttttgagtgtgtgttttggctctctcactgagtttgtgga-atgtatatttcag

upper sequence: GLYMA09G36870.1 (Glycine max), 5'ss of exon 4
lower sequence: Vv01s0011g06630.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 7
ATTCTTCAAGAAGAAATTGGGGGTGTGAAAGGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctctgttctt----cacctcccttttgtttt-gcttcatgacatacttttattcaatgaaaccttccgttcgttggagaaattgacaaccatgcttat
|||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| |||||   | |||  | ||    ||  |   |  || ||  | ||| | | | |   ||  | |   ||| || |   |  |   |   |     || ||  ||   
ATTCTTCAAGAAGAAATTGGAGGTGTGAAAGGGCACTTTGGACCTATAAATGCTTTAGCATTCAACCCTGATGGAAAGAGgtacactttcttctattatggcatgttattgctgattaagtttcttaaaaca---ttgatgagcaaaagctccacattttcaaatttaggttgaaacaccctc--

upper sequence: GLYMA09G36870.1 (Glycine max), 5'ss of exon 4
lower sequence: PP1S65_136V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 6
ATTCTTCAAGAAGAAATTGGGGGTGTGAAAGGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctctgt---tcttcacctcccttttgttttgcttcatgacatacttttattcaatgaaaccttccgttcgttggagaaattgacaaccatgcttat-----------------------
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ATTTTTGAGGAAGAGATTGGGGGTGTGAAGGGTCACTTTGGACCTATAAATGCCCTGGCTTTTAATCCGGACGGTAGAAGgtgcgcttcttgggggtctgtcagaccaactgggcttgc--cacgtcaaggttatgttttgtta-----tttgt-cattgggaaaataacaagttttactgattgttgaaacttgtggtttttcag

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|207781425|gb|GD752786.1|GD752786
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACG
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACG
EST: gi|193699826|gb|FK635801.1|FK635801
EST:     CCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTGTGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: CCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|193670465|gb|FK610349.1|FK610349
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACGTCGACCC
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|193566289|gb|FK524092.1|FK524092
EST:     GCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: GCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAA-CCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|207760801|gb|GD734124.1|GD734124
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGA
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGA
EST: gi|193731634|gb|FK665404.1|FK665404
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|193388295|gb|FK356148.1|FK356148
EST:     GCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: GCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTT-AACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|193557140|gb|FK512783.1|FK512783
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTC-AGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|193568285|gb|FK523894.1|FK523894
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|193324290|gb|FK288832.1|FK288832
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTA
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTA
EST: gi|208083497|gb|GD883097.1|GD883097
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCACTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGGAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|193566501|gb|FK522460.1|FK522460
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|7639005|gb|AW733337.1|AW733337
EST:     GCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAAG                         TTTT-CAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACC
genomic: GCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAA-Ggtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACC
EST: gi|193527517|gb|FK484279.1|FK484279
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|193328964|gb|FK295208.1|FK295208
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|193474692|gb|FK439331.1|FK439331
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|57575042|gb|CX548017.1|CX548017
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|208143574|gb|GD942004.1|GD942004
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|193524469|gb|FK483096.1|FK483096
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|193565006|gb|FK520149.1|FK520149
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGT
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGT
EST: gi|193306883|gb|FK269785.1|FK269785
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|208184959|gb|GD981165.1|GD981165
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|208156644|gb|GD957220.1|GD957220
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATCGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|193699811|gb|FK641694.1|FK641694
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|208072846|gb|GD871103.1|GD871103
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAGCCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|208122371|gb|GD920836.1|GD920836
EST:     AATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: AATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|208194170|gb|GD989875.1|GD989875
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|208172920|gb|GD969411.1|GD969411
EST:     GCCACTTTGGACCAATTTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: GCCACTTTGGACCAA-TTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|193512979|gb|FK470527.1|FK470527
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|193698005|gb|FK635744.1|FK635744
EST:     GGCCACTTCGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGG-AAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|193328386|gb|FK295961.1|FK295961
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|193674611|gb|FK618207.1|FK618207
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|193718641|gb|FK652611.1|FK652611
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
genomic: GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGCTTTTAACCCTGATGGAAAAAGgtatgttctc ... tcttttgcagTTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
EST: gi|208180232|gb|GD973689.1|GD973689
EST:     GGCCACTTTGGACCAATTAATGCATTGGTTTTTAACCCTGATGGAAAAAG                         TTTTTCAAGTGGAGGTGAAGATGGTTATGTACGGTTGCACCACTTCGACCC
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Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
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