Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TAGAACAACAACGTCTCCATGCTGGTGTTCACCTCAAGTCCAAATACAAGGCTTACCAATATGTTCTATGGATTGTCTCTGCCATTTTACTGATTGTTGGgtgagttactttcttaaatccttgaaactcataaagctatattattgtcatggttcagctgtttttggtctaggaaatgaaattatattaatttgctata...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA09G26610.1
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|208308147|gb|GE105935.1|GE105935
EST:     GCTTACCAATATGTTCTATGGATTGTCTCTGCCATTTTACTGATTGTTGG                         GTTATCTATTGCTCTAGTGATGCTATTCCGGGGTGAGAGTGGATATGATCA
genomic: GCTTACCAATATGTTCTATGGATTGTCTCTGCCATTTTACTGATTGTTGGgtgagttact ... tgaatgtcagGTTATCTATTGCTCTAGTGATGCTATTCCGGGGTGAGAGTGGATATGATCA
EST: gi|8286335|gb|BE023894.1|BE023894
EST:     GCTTACCAATATGTTCTATGGATTGTCTCTGCCATTTTACTGATTGTTGG                         GTTATCTATTGCTCTAGTGATGCTATTCCGGGGTGAGAGTGGATATGATCA
genomic: GCTTACCAATATGTTCTATGGATTGTCTCTGCCATTTTACTGATTGTTGGgtgagttact ... tgaatgtcagGTTATCTATTGCTCTAGTGATGCTATTCCGGGGTGAGAGTGGATATGATCA
EST: gi|6454385|gb|AW185068.1|AW185068
EST:     GCTTACCAATATGTTCTATGGATTGTCTCTGCCATTTTACTGATTGTTGG                         GTTATCTATTGCTCTAGTGATGCTATTCCGGGGTGAGAGTGGATATGATCA
genomic: GCTTACCAATATGTTCTATGGATTGTCTCTGCCATTTTACTGATTGTTGGgtgagttact ... tgaatgtcagGTTATCTATTGCTCTAGTGATGCTATTCCGGGGTGAGAGTGGATATGATCA
EST: gi|193731612|gb|FK665396.1|FK665396
EST:     GCTTACCAATATGTTCTATGGATTGTCTCTGCCATTTTACTGATTGTTGG                         GTTATCTATTGCTCTAGTGATGCTATTCCGGGGTGAGAGTGGATATGATCA
genomic: GCTTACCAATATGTTCTATGGATTGTCTCTGCCATTTTACTGATTGTTGGgtgagttact ... tgaatgtcagGTTATCTATTGCTCTAGTGATGCTATTCCGGGGTGAGAGTGGATATGATCA
EST: gi|207806094|gb|GD779215.1|GD779215
EST:     GCTTACCAATATGTTCTATGGATTGTCTCTGCCATTTTACTGATTGTTGG                         GTTATCTAATTAGCTCTAGTG
genomic: GCTTACCAATATGTTCTATGGATTGTCTCTGCCATTTTACTGATTGTTGGgtgagttact ... tgaatgtcagGTTATCTA-TT-GCTCTAGTG
EST: gi|207826389|gb|GD799472.1|GD799472
EST:     GCTTACCAATATGTTCTATGGATTGTCTCTGCCATTTTACTGATTGTAGG                         GTTATCTATTGCTCTAGTGATGCTATTCCGGGGTGAGAGTGGATATGATCA
genomic: GCTTACCAATATGTTCTATGGATTGTCTCTGCCATTTTACTGATTGTTGGgtgagttact ... tgaatgtcagGTTATCTATTGCTCTAGTGATGCTATTCCGGGGTGAGAGTGGATATGATCA
EST: gi|193727168|gb|FK662860.1|FK662860
EST:     GCTTACCAATATGTTCTATGGATTGTCTCTGCCATTTTACTGATTGTTGG                         GTTATCTATTGCTCTAGTGATGCTATTCCGGGGTGAGAGTGGATATGATCA
genomic: GCTTACCAATATGTTCTATGGATTGTCTCTGCCATTTTACTGATTGTTGGgtgagttact ... tgaatgtcagGTTATCTATTGCTCTAGTGATGCTATTCCGGGGTGAGAGTGGATATGATCA
EST: gi|208078957|gb|GD876573.1|GD876573
EST:     CTTACCAATATGTTCTATGGATTGTCTCTGCCATTTTTACTGATTGTTGG                         GTTATCTATTGCTCTAGTGATGCTATTCCGGGGTGAGAGTGGATA
genomic: CTTACCAATATGTTCTATGGATTGTCTCTGCCATTTT-ACTGATTGTTGGgtgagttact ... tgaatgtcagGTTATCTATTGCTCTAGTGATGCTATTCCGGGGTGAGAGTGGATA