1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
GGTTGATCGCCCCAATGTGTATATTAAGATTCCTGCTACAGAGGCATGTGTGCCTTCAATTAAGGAAGTTATTGCTAATGGGATAAGTGTGAATGTGACGgtaagtttgtgccacatcctttcatgtaatctgcaaattaaataaattagtatcatatattgttatgatatgctgttctaggttgggttattagctactt...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA08G47790.3 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TGCCTTCAATTAAAGAAGTTATTGCTAATGGGATAAGTGTGAATGTGACG CTGATATTCTCTCTTGCAAGATATGAAGCTGTAATAGATGCTTACTTGGATEST: gi|26059043|gb|CA801957.1|CA801957
genomic: TGCCTTCAATTAAGGAAGTTATTGCTAATGGGATAAGTGTGAATGTGACGgtaagtttgt ... gtatgcacagCTGATATTCTCTCTTGCAAGATATGAAGCTGTAATAGATGCTTACTTGGAT
EST: TGCCTTCAATTAAGGAAGTTATTGCTAATGGGATAAGTGTGAATGTGACG CTGATATTCTCTCTTGCAAGATATGAAGCTGTAATAGATGCTTACTTGGATEST: gi|18692732|gb|BM521580.1|BM521580
genomic: TGCCTTCAATTAAGGAAGTTATTGCTAATGGGATAAGTGTGAATGTGACGgtaagtttgt ... gtatgcacagCTGATATTCTCTCTTGCAAGATATGAAGCTGTAATAGATGCTTACTTGGAT
EST: TGCCTTCAATTAAGGAAGTTATTGCTAATGGGATAAGTGTGAATGTGACG CTGATATTCTCTCTTGCAAGATATGAAGCTGTAATAGATGCTTACTTGGATEST: gi|254346140|gb|GR859753.1|GR859753
genomic: TGCCTTCAATTAAGGAAGTTATTGCTAATGGGATAAGTGTGAATGTGACGgtaagtttgt ... gtatgcacagCTGATATTCTCTCTTGCAAGATATGAAGCTGTAATAGATGCTTACTTGGAT
EST: GCCTTCAATTAAAGGAAGTTATTGCTAATGGGATAAGTGTGAATGTGACG CTGATATTCTCTCTTGCAAGATATGAAGCTGTAATAGATGCTTAEST: gi|8283342|gb|BE020903.1|BE020903
genomic: GCCTTCAATTAA-GGAAGTTATTGCTAATGGGATAAGTGTGAATGTGACGgtaagtttgt ... gtatgcacagCTGATATTCTCTCTTGCAAGATATGAAGCTGTAATAGATGCTTA
EST: TGCCTTCAATTAAGGAAGTTATTGCTGATGGGATAAGTGTGAATGTGACG CTGGTATTCTCTCTTGCGAGATATGAAGCTGTAATAGATGCTTACTTGEST: gi|19271012|gb|BM887268.1|BM887268
genomic: TGCCTTCAATTAAGGAAGTTATTGCTAATGGGATAAGTGTGAATGTGACGgtaagtttgt ... gtatgcacagCTGATATTCTCTCTTGCAAGATATGAAGCTGTAATAGATGCTTACTTG
EST: TGCCTTCAATTAAGGAAGTTATTGCTAATGGGATAAGTGTGAATGTGACG CTGATATTCTCTCTTGCAAGATATGAAGCTGTAATAGATGCTTACTTGGATEST: gi|308098290|gb|HO760031.1|HO760031
genomic: TGCCTTCAATTAAGGAAGTTATTGCTAATGGGATAAGTGTGAATGTGACGgtaagtttgt ... gtatgcacagCTGATATTCTCTCTTGCAAGATATGAAGCTGTAATAGATGCTTACTTGGAT
EST: TGCCTTCAATTAAGGAAGTTATTGCTAATGGGATAAGTGTGAATGTGACG CTGATATTCTCTCTTGCAAGATATGAAGCTGTAATAGATGCTTACTTGGATEST: gi|254326716|gb|GR832868.1|GR832868
genomic: TGCCTTCAATTAAGGAAGTTATTGCTAATGGGATAAGTGTGAATGTGACGgtaagtttgt ... gtatgcacagCTGATATTCTCTCTTGCAAGATATGAAGCTGTAATAGATGCTTACTTGGAT
EST: TGCCTTCAATTAAGGAAGTTATTGCTAATGGGATAAGTGTGAATGTGACG CTGATATTCTCTCTTGCAAGATATGAAGCTGTAATAGATGCTTACTTGGGAEST: gi|10233938|gb|BE802826.1|BE802826
genomic: TGCCTTCAATTAAGGAAGTTATTGCTAATGGGATAAGTGTGAATGTGACGgtaagtttgt ... gtatgcacagCTGATATTCTCTCTTGCAAGATATGAAGCTGTAATAGATGCTTACTTGG-A
EST: TGCCTTCAATTAAGGAAGTTATTGCTAATGGGATAC-TGTGAATGTGACG CTGATATTCTCTCTTGCAAGATATGAAGCTGTAATAGATGCTTACTTGGATEST: gi|17022331|gb|BM093365.1|BM093365
genomic: TGCCTTCAATTAAGGAAGTTATTGCTAATGGGATAAGTGTGAATGTGACGgtaagtttgt ... gtatgcacagCTGATATTCTCTCTTGCAAGATATGAAGCTGTAATAGATGCTTACTTGGAT
EST: TGCCTTCAATTAAGGAAGTTATTGCTAATGGGATAAGTGTGAATGTGACG CTGATATTCTCTCTTGCAAGATATEST: gi|254322565|gb|GR837979.1|GR837979
genomic: TGCCTTCAATTAAGGAAGTTATTGCTAATGGGATAAGTGTGAATGTGACGgtaagtttgt ... gtatgcacagCTGATATTCTCTCTTGCAAGATAT
EST: TGCCTTCAATTAAGGAAGTTATTGCTAATGGGATAAGTGTGAATGTGACG CTGATATTCTCTCTTGCAAGATATGAAGCTGTAATAGATGCTTACTTGGAT
genomic: TGCCTTCAATTAAGGAAGTTATTGCTAATGGGATAAGTGTGAATGTGACGgtaagtttgt ... gtatgcacagCTGATATTCTCTCTTGCAAGATATGAAGCTGTAATAGATGCTTACTTGGAT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GGTTGATCGCCCCAATGTGTATATTAAGATTCCTGCTACAGAGGCATGTGTGCCTTCAATTAAGGAAGTTATTGCTAATGGGATAAGTGTGAATGTGACGgtaagtttgtgccacatcctttcatgtaatctgcaaattaaataaattagtatcatatattgttatgatatgctgttctaggttgggttattagctactt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGGAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - aaattaaa