1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
AGAGAATCCGAAGATAGTGACAAAATGCTCTCATCATTTTCATCTTGGTTGCATTTATGAGTGGATGGAAAGAAGTGACAGCTGTCCTGTTTGTGGGAAGgtaatatttacttggtattttcgaattatttctcactgaaatgaccaagttcaacagaaattagtgcatagaacacatcaaagcagtaggatgagaacct...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA08G27730.1 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GCATTTATGAGTGGATGGAAAGAAGTGACAGCTGTCCTGTTTGTGGGAAG GTGATGGTATTTGATGAAACGACTGATTGAAAAGGTTTATGTCGTGGATGAEST: gi|207789055|gb|GD762167.1|GD762167
genomic: GCATTTATGAGTGGATGGAAAGAAGTGACAGCTGTCCTGTTTGTGGGAAGgtaatattta ... tttggtgtagGTGATGGTATTTGATGAAACGACTGATTGAAAAGGTTTATGTCGTGGATGA
EST: GCATTTATGAGTGGATGGAAAGAAGTGACAGCTGTCCTGTTTGTGGGAAG GTGATGGTATTTGATGAAACGACTGATTGAAAAGGTTTATGTCGTGGATGAEST: gi|192304400|gb|FG996722.1|FG996722
genomic: GCATTTATGAGTGGATGGAAAGAAGTGACAGCTGTCCTGTTTGTGGGAAGgtaatattta ... tttggtgtagGTGATGGTATTTGATGAAACGACTGATTGAAAAGGTTTATGTCGTGGATGA
EST: GCATTTATGAGTGGATGGAAAGAAGTGACAGCTGTCCTGTTTGTGGGAAG GTGATGGTATTTGATGAAACGACTGATTGAAAAGGTTTATGTCGTGGATGAEST: gi|22928658|gb|BU545797.1|BU545797
genomic: GCATTTATGAGTGGATGGAAAGAAGTGACAGCTGTCCTGTTTGTGGGAAGgtaatattta ... tttggtgtagGTGATGGTATTTGATGAAACGACTGATTGAAAAGGTTTATGTCGTGGATGA
EST: GCATTTATGAGTGGATGGAAAGAAGTGACAGCTGTCCTGTTTGTGGGAAG GTGATGGTATTTGATGAAACGACTGATTGAAAAGGTTTATGTCGTGGATGAEST: gi|207695267|gb|GD678064.1|GD678064
genomic: GCATTTATGAGTGGATGGAAAGAAGTGACAGCTGTCCTGTTTGTGGGAAGgtaatattta ... tttggtgtagGTGATGGTATTTGATGAAACGACTGATTGAAAAGGTTTATGTCGTGGATGA
EST: GCATTTATGAGTGGATGGAAAGAAGTGACAGCTGTCCTGTTTGTGGGAAG GTGATGGTATTTGATGAAACGACTGATTGAAAAGGTTTATGTCGTGGATGAEST: gi|7684829|gb|AW755477.1|AW755477
genomic: GCATTTATGAGTGGATGGAAAGAAGTGACAGCTGTCCTGTTTGTGGGAAGgtaatattta ... tttggtgtagGTGATGGTATTTGATGAAACGACTGATTGAAAAGGTTTATGTCGTGGATGA
EST: GCATTTATGAGTGGATGGAAAGAAGTGACAGCTGTCCTGTTTGTGGGAAG GTGATGGTATTTGATGAAACGACTGATTGAAAAEST: gi|192307749|gb|FK001693.1|FK001693
genomic: GCATTTATGAGTGGATGGAAAGAAGTGACAGCTGTCCTGTTTGTGGGAAGgtaatattta ... tttggtgtagGTGATGGTATTTGATGAAACGACTGATTGAAAA
EST: GCATTTATGAGTGGATGGAAAGAAGTGACAGCTGTCCTGTTTGTGGGAAG GTGATGGTATTTGATGAAACGACTGATTGAAAAGGTTTATGTCGTGGATGA
genomic: GCATTTATGAGTGGATGGAAAGAAGTGACAGCTGTCCTGTTTGTGGGAAGgtaatattta ... tttggtgtagGTGATGGTATTTGATGAAACGACTGATTGAAAAGGTTTATGTCGTGGATGA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| AGAGAATCCGAAGATAGTGACAAAATGCTCTCATCATTTTCATCTTGGTTGCATTTATGAGTGGATGGAAAGAAGTGACAGCTGTCCTGTTTGTGGGAAGgtaatatttacttggtattttcgaattatttctcactgaaatgaccaagttcaacagaaattagtgcatagaacacatcaaagcagtaggatgagaacct
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGTGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GATGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAAGAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGAAGT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CAGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - aacagaaa