Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GCTTCCAGTTGGATCTCGAGTTGTTGGGGCCTTCATCATGCCTTGTGGCAACTGCTCCTACTGTTCAAAGgtaaaatattgtgttagacacttcactcttatatgttgactggattcatgttcattgttgatgttgtctccaaatgttatacag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA08G00740.2
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|254329030|gb|GR833402.1|GR833402
EST:     TTGTTGGGGCCTTCATCATGCCTTGTGGCAACTGCTCCTACTGTTCAAAG                         GGCCATGATGATCTATGTGAAGCTTTCTTTGCCTATAACCGGGCAAAAGGA
genomic: TTGTTGGGGCCTTCATCATGCCTTGTGGCAACTGCTCCTACTGTTCAAAGgtaaaatatt ... tgttatacagGGCCATGATGATCTATGTGAAGCTTTCTTTGCCTATAACCGGGCAAAAGGA
EST: gi|192331064|gb|FK020284.1|FK020284
EST:     TTGTTGGGGCCTTCATCATGCCTTGTGGCAACTGCTCCTACTGTTCAAAG                         GGCCATGATGATCTATGTGAAGCTTTCTTTGCCTATAACCGGGCAAAAGGA
genomic: TTGTTGGGGCCTTCATCATGCCTTGTGGCAACTGCTCCTACTGTTCAAAGgtaaaatatt ... tgttatacagGGCCATGATGATCTATGTGAAGCTTTCTTTGCCTATAACCGGGCAAAAGGA
EST: gi|192294016|gb|FG987185.1|FG987185
EST:     TTGTTGGGGCCTTCATCATGCCTTGTGGCAACTGCTCCTACTGTTCAAAG                         GGCCATGATGATCTATGTGAAGCTTTCTTTGCCTATAACCGGGCAAAAGGA
genomic: TTGTTGGGGCCTTCATCATGCCTTGTGGCAACTGCTCCTACTGTTCAAAGgtaaaatatt ... tgttatacagGGCCATGATGATCTATGTGAAGCTTTCTTTGCCTATAACCGGGCAAAAGGA
EST: gi|192330970|gb|FK023125.1|FK023125
EST:     TTGTTGGGGCCTTCATCATGCCTTGTGGCAACTGCTCCTACTGTTCAAAG                         GGCCATGATGATCTATGTGA
genomic: TTGTTGGGGCCTTCATCATGCCTTGTGGCAACTGCTCCTACTGTTCAAAGgtaaaatatt ... tgttatacagGGCCATGATGATCTATGTGA
EST: gi|254330134|gb|GR839687.1|GR839687
EST:     TTGTTGGGGCCTTCATCATGCCTTGTGGCAACTGCTCCTACTGTTCAAAG                         GGCCATGATGATCTATGTGAAGCTTTCTTTGCCTATAACCGGGCAAAAGGA
genomic: TTGTTGGGGCCTTCATCATGCCTTGTGGCAACTGCTCCTACTGTTCAAAGgtaaaatatt ... tgttatacagGGCCATGATGATCTATGTGAAGCTTTCTTTGCCTATAACCGGGCAAAAGGA