Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ATACGAGATTGGATTGCCATTCATTCAAAAGGCAGGAATGGAGCACAAAATTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAATgtaagtttttctatattttgattgaaattgtgttatggtaattacttgacagtttaaactggttttttatgtgataatatacgattttctatagtattca...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA05G27960.2
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|120496500|gb|EH224667.1|EH224667
EST:     TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAAT                         GATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
genomic: TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAATgtaagttttt ... aaaattgcagGATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
EST: gi|120494335|gb|EH222502.1|EH222502
EST:     TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAAT                         GATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
genomic: TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAATgtaagttttt ... aaaattgcagGATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
EST: gi|120496380|gb|EH224547.1|EH224547
EST:     TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAAT                         GATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
genomic: TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAATgtaagttttt ... aaaattgcagGATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
EST: gi|23057239|gb|BU577914.1|BU577914
EST:     TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAAT                         GATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
genomic: TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAATgtaagttttt ... aaaattgcagGATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
EST: gi|23064307|gb|BU579089.1|BU579089
EST:     TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAAT                         GATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
genomic: TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAATgtaagttttt ... aaaattgcagGATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
EST: gi|22934232|gb|BU551371.1|BU551371
EST:     TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAAT                         GATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
genomic: TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAATgtaagttttt ... aaaattgcagGATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
EST: gi|120496499|gb|EH224666.1|EH224666
EST:     TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAAT                         GATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
genomic: TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAATgtaagttttt ... aaaattgcagGATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
EST: gi|13479213|gb|BG508556.1|BG508556
EST:     TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAAT                         GATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
genomic: TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAATgtaagttttt ... aaaattgcagGATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
EST: gi|151403065|gb|EV272875.1|EV272875
EST:     TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAAT                         GATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
genomic: TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAATgtaagttttt ... aaaattgcagGATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
EST: gi|15000285|gb|BI321099.1|BI321099
EST:     TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAAT                         GATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
genomic: TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAATgtaagttttt ... aaaattgcagGATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
EST: gi|23064557|gb|BU579330.1|BU579330
EST:     TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAAT                         GATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
genomic: TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAATgtaagttttt ... aaaattgcagGATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
EST: gi|120529047|gb|EH257181.1|EH257181
EST:     TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAAT                         GATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
genomic: TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAATgtaagttttt ... aaaattgcagGATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
EST: gi|17962915|gb|BM269671.1|BM269671
EST:     TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAAT                         GATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
genomic: TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAATgtaagttttt ... aaaattgcagGATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
EST: gi|120494453|gb|EH222620.1|EH222620
EST:     TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAAT                         GATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
genomic: TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAATgtaagttttt ... aaaattgcagGATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
EST: gi|120496135|gb|EH224302.1|EH224302
EST:     TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAAT                         GATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA
genomic: TTGACTTTATCCTTGGTGATGCATTATCAGTTCTCAACGATCTTATTAATgtaagttttt ... aaaattgcagGATAAGCATGAAGACTCATTTGACTATGTATTTGTGGATGCGGATAAAGCA