1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgtttttctaatgataactgtgattggtttcatgttttcttttcacattgtgtcttaactctaattattgcttgacctttgactgaatgcaatctgtttttcag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA04G37120.2 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCTTCTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGTGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|192309529|gb|FK000191.1|FK000191
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|207842015|gb|GD816335.1|GD816335
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATEST: gi|58017474|gb|CX704216.1|CX704216
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGAT
EST: GATCGCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACAGTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|151401263|gb|EV271077.1|EV271077
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|9258998|gb|BE347145.1|BE347145
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|17963409|gb|BM270158.1|BM270158
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|18692713|gb|BM521561.1|BM521561
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|31307073|gb|CD392276.1|CD392276
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: ACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|31462978|gb|CD405006.1|CD405006
genomic: ACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: CCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTTCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|208302968|gb|GE099585.1|GE099585
genomic: CCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|192329979|gb|FK021565.1|FK021565
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|213620429|gb|DB957326.1|DB957326
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAEST: gi|151396767|gb|EV266640.1|EV266640
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|58015143|gb|CX701885.1|CX701885
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|19347879|gb|BM892503.1|BM892503
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|31561132|gb|CD486970.1|CD486970
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|298187616|gb|HO034765.1|HO034765
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|7795303|gb|AW780700.1|AW780700
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCTTCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|192329978|gb|FK021564.1|FK021564
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|254318263|gb|GR832431.1|GR832431
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|15813356|gb|BI785631.1|BI785631
genomic: GTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|254314708|gb|GR829701.1|GR829701
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|4436972|gb|AI522837.1|AI522837
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: TGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|192300142|gb|FG989264.1|FG989264
genomic: TGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGCGAAEST: gi|254314709|gb|GR829702.1|GR829702
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GAT-CCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACT-CCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|208272061|gb|GE069207.1|GE069207
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGACGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|298169520|gb|HO020880.1|HO020880
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|19348668|gb|BM893200.1|BM893200
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|192295190|gb|FG986909.1|FG986909
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|26058029|gb|CA800943.1|CA800943
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|298185314|gb|HO030527.1|HO030527
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAEST: gi|207774367|gb|GD746261.1|GD746261
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGA
EST: CCCCCACGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGGTTTGTTTGGTGAAEST: gi|42722502|gb|CK768401.1|CK768401
genomic: CCCCCA-GCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|207817388|gb|GD789349.1|GD789349
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: CGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|15287608|gb|BI471499.1|BI471499
genomic: CGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|7685411|gb|AW756059.1|AW756059
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|208063571|gb|GD861501.1|GD861501
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|4286063|gb|AI440993.1|AI440993
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: CGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|254318262|gb|GR832430.1|GR832430
genomic: CGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|298165799|gb|HO008770.1|HO008770
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|9564337|gb|BE473846.1|BE473846
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|151409150|gb|EV278958.1|EV278958
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCTTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|18038851|gb|BM307145.1|BM307145
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|11690340|gb|BF598016.1|BF598016
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|298186801|gb|HO037434.1|HO037434
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|31463360|gb|CD405388.1|CD405388
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCTTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|151402916|gb|EV272729.1|EV272729
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAAEST: gi|11687926|gb|BF595602.1|BF595602
genomic: GATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
EST: TGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG GCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
genomic: TGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgttt ... tgtttttcagGCTGCTGTTGCTGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATTTGTTTGGTGAA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAGgcaagtgtttttctaatgataactgtgattggtttcatgttttcttttcacattgtgtcttaactctaattattgcttgacctttgactgaatgcaatctgtttttcag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CAGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT