1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATTGTTGGGCTAGCTGATTTTAATAAATTGAGTGCTAAGCTCATTTTTGGGGCTGACAGgttaataataaaaacaatataagtgctttcttgtttgtaaagatttttgctgatcagtacctaattttttgtgcttacatttttttttttttgttatag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA04G08560.1 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CTAGCTGATTTTAATAAATTGAGTGCTAAGCTCATTTTTGGGGCTGACAG CCCTGCTATTCAAGACAACAGGGTTACCACTGTTCAATGCTTGTCTGGAACEST: gi|192306580|gb|FG996242.1|FG996242
genomic: CTAGCTGATTTTAATAAATTGAGTGCTAAGCTCATTTTTGGGGCTGACAGgttaataata ... tttgttatagCCCTGCTATTCAAGACAACAGGGTTACCACTGTTCAATGCTTGTCTGGAAC
EST: CTAGCTGATTTTAATAAATTGAGTGCTAAGCTCATTTTTGGGGCTGACAG CCCTGCTATTCAAGACAACAGGGTTACCACTGTTCAATGCTTGTCTGGAACEST: gi|254321007|gb|GR827456.1|GR827456
genomic: CTAGCTGATTTTAATAAATTGAGTGCTAAGCTCATTTTTGGGGCTGACAGgttaataata ... tttgttatagCCCTGCTATTCAAGACAACAGGGTTACCACTGTTCAATGCTTGTCTGGAAC
EST: CTAGCTGATTTTAATAAATTGAGTGCTAAGCTCATTTTTGGGGCTGACAG CCCTGCTATTCAAGACAACAGGGTTACCACTGTTCAATGCTTGTCTGGAACEST: gi|17022645|gb|BM093679.1|BM093679
genomic: CTAGCTGATTTTAATAAATTGAGTGCTAAGCTCATTTTTGGGGCTGACAGgttaataata ... tttgttatagCCCTGCTATTCAAGACAACAGGGTTACCACTGTTCAATGCTTGTCTGGAAC
EST: CTAGCTGATTTTAATAAATTGAGTGCTAAGCTCATTTTTGGGGCTGACAG CCCTGCTATTCAAGACAACAGGGTTACCACTGTTCAATGCTTGTCTGGAACEST: gi|192334119|gb|FK026276.1|FK026276
genomic: CTAGCTGATTTTAATAAATTGAGTGCTAAGCTCATTTTTGGGGCTGACAGgttaataata ... tttgttatagCCCTGCTATTCAAGACAACAGGGTTACCACTGTTCAATGCTTGTCTGGAAC
EST: CTAGCTGATTTTAATAAATTGAGTGCTAAGCTCATTTTTGGGGCTGACAG CCCTGCTATTCAAGACAACAGGGTTACCACTGTTCAATGCTTGTCTGGAACEST: gi|192326177|gb|FK016279.1|FK016279
genomic: CTAGCTGATTTTAATAAATTGAGTGCTAAGCTCATTTTTGGGGCTGACAGgttaataata ... tttgttatagCCCTGCTATTCAAGACAACAGGGTTACCACTGTTCAATGCTTGTCTGGAAC
EST: CTAGCTGATTTTAATAAATTGAGTGCTAAACTCATTTTTGGGGCTGACAG CCCTGCTATTCAAGACAACAGGGTTACCACTGTTCAATGCTTGTCTGGAAC
genomic: CTAGCTGATTTTAATAAATTGAGTGCTAAGCTCATTTTTGGGGCTGACAGgttaataata ... tttgttatagCCCTGCTATTCAAGACAACAGGGTTACCACTGTTCAATGCTTGTCTGGAAC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATTGTTGGGCTAGCTGATTTTAATAAATTGAGTGCTAAGCTCATTTTTGGGGCTGACAGgttaataataaaaacaatataagtgctttcttgtttgtaaagatttttgctgatcagtacctaattttttgtgcttacatttttttttttttgttatag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTCA