Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   
2  
 5'  3'   
3  
 5'  3'   
4  
 5'  3'   
5  
 5'  3'   
6  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GGTCCTCTTCCAATTTGAAGCTAGCGAGGATGGACAAGTCCAGTTCTTTCCAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAATgtatagacaatagcttttgttcttgtgggttcattattaggcgttttatgtgatgactgatgatatttgtttcttgatttatcttaacag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA02G46230.1
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|7326949|gb|AW620747.1|AW620747
EST:     CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAAT                         GTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATATTTGAG
genomic: CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAATgtatagacaa ... atcttaacagGTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATATTTGAG
EST: gi|12691114|gb|BG157450.1|BG157450
EST:     CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAAT                         GTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATACCGCGC
genomic: CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAATgtatagacaa ... atcttaacagGTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGC
EST: gi|298182882|gb|HO031617.1|HO031617
EST:     CAAATGCCCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAAT                         GTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATATTTGAG
genomic: CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAATgtatagacaa ... atcttaacagGTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATATTTGAG
EST: gi|11413167|gb|BF425178.1|BF425178
EST:     CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAAT                         GTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATATTTGAG
genomic: CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAATgtatagacaa ... atcttaacagGTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATATTTGAG
EST: gi|7146907|gb|AW508829.1|AW508829
EST:     CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAAT                         GTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATATTTGAG
genomic: CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAATgtatagacaa ... atcttaacagGTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATATTTGAG
EST: gi|14205548|gb|BG839226.1|BG839226
EST:     CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAAT                         GTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATATTTGAG
genomic: CAAATGCTCCAGTTGATGTTGACAATTCTCCCAGCTTTGTTGCCATCAATgtatagacaa ... atcttaacagGTCAGTCCTATTGAGTATGGGCATGTTTTGCTGATTCCGCGCATATTTGAG