1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
GTGTGAAGCTTTTTCAACATATCCTCGAACCTATGACCTCCTTCATCTTGATGGACTCTTCACTGCTGAAAGCCACAGgtgagtatgtgaactcatttactctcattagtaacataaacatggagacactcactctaaacttagatttttgaatatgtttctgacaatggttgttttgttactttacag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA01G35220.2 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: ACCTATGACCTCCTTCATCTTGATGGACTCTTCACTGCTGAAAGCCACAG ATGTGAAAATAGAAGTATGTGTEST: gi|6566331|gb|AW234004.1|AW234004
genomic: ACCTATGACCTCCTTCATCTTGATGGACTCTTCACTGCTGAAAGCCACAGgtgagtatgt ... tactttacagATGTGAAA-T-GAAGTATGTGT
EST: ACCTATGACCTCCTTCATCTTGATGGACTCTTCACTGCTGAAAGCCACAG ATGTGAAATGAAGTATGTGTTGCTGGAAATGGATCGAATTTTAAGGCCTGGEST: gi|51342372|gb|CO983451.1|CO983451
genomic: ACCTATGACCTCCTTCATCTTGATGGACTCTTCACTGCTGAAAGCCACAGgtgagtatgt ... tactttacagATGTGAAATGAAGTATGTGTTGCTGGAAATGGATCGAATTTTAAGGCCTGG
EST: ACCTATGACCTCCTTCATCTTGATGGACTCTTCACTGCTGAAAGCCACAG ATGTGAAATGAAGTATGTGTTGCTGGAAATGGATCGAATTTTAAGGCCTGGEST: gi|10843315|gb|BF067170.1|BF067170
genomic: ACCTATGACCTCCTTCATCTTGATGGACTCTTCACTGCTGAAAGCCACAGgtgagtatgt ... tactttacagATGTGAAATGAAGTATGTGTTGCTGGAAATGGATCGAATTTTAAGGCCTGG
EST: ACCTATGACCTCCTTCATCTTGATGGACTCTTCACTGCTGAAAGCCACAG ATGTGAAATGAAGTATGTGTTGCTGGAAATGGATCGAATTTTAAGGCCTGG
genomic: ACCTATGACCTCCTTCATCTTGATGGACTCTTCACTGCTGAAAGCCACAGgtgagtatgt ... tactttacagATGTGAAATGAAGTATGTGTTGCTGGAAATGGATCGAATTTTAAGGCCTGG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GTGTGAAGCTTTTTCAACATATCCTCGAACCTATGACCTCCTTCATCTTGATGGACTCTTCACTGCTGAAAGCCACAGgtgagtatgtgaactcatttactctcattagtaacataaacatggagacactcactctaaacttagatttttgaatatgtttctgacaatggttgttttgttactttacag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GATGGA