1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
GCTAATAACCGGGACTTGCTCTGGTGTTTGGGCATGGATTAAATGGAATGATAGGGCTTTTATGATTGGGTCCACGTCTATGCTCATGGGAATGATCTTGgtaagtttaaaacctccttgtttaaagttttttctttttagacggctacatgctggttattgaacttcctatcctctaaagttggtctggtaaagctacg...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA01G21270.3 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: ATAGGGCTTTTATGATTGGGTCCACGTCTATGCTCATGGGAATGATCTTG GTTGGAGTTGCTATGGTTGTGGTGGAAAGTGCTGTTACATCEST: gi|193660994|gb|FK603516.1|FK603516
genomic: ATAGGGCTTTTATGATTGGGTCCACGTCTATGCTCATGGGAATGATCTTGgtaagtttaa ... gtattttcagGTTGGAGTTGCTATGGTTGTGGTGGAAAGTGCTGTTACATC
EST: ATAGGGCTTTTATGATTGGGTCCACGTCTATGCTCATGGGAATGATCTTG GTTGGAGTTGCTATGGTTGTGGTGGAAAGTGCTGTTACATC
genomic: ATAGGGCTTTTATGATTGGGTCCACGTCTATGCTCATGGGAATGATCTTGgtaagtttaa ... gtattttcagGTTGGAGTTGCTATGGTTGTGGTGGAAAGTGCTGTTACATC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GCTAATAACCGGGACTTGCTCTGGTGTTTGGGCATGGATTAAATGGAATGATAGGGCTTTTATGATTGGGTCCACGTCTATGCTCATGGGAATGATCTTGgtaagtttaaaacctccttgtttaaagttttttctttttagacggctacatgctggttattgaacttcctatcctctaaagttggtctggtaaagctacg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - cctcctt