1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
TCCAGACTACATAGTTCTGAAATCGTTGGATACTGATGGTATCCGTATAATTGGAAGTGTATTGGGACAAAGCATAGCTCTGGATTATTTTGTCTCACAGgttaatatgtgccaaatgtcatcttctttccagtactttgttggccatttgttaccctgaaggaaaaagacaacccttaaactgaagccgttaatttttattttaaaagaagccattgactttttggcatttgctctctctcattatcag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA01G06630.1 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TTGGAAGTGTATTGGGACAAAGCATAGCTCTGGATTATTTTGTCTCACAG GTTGATGGTTTAGTTGAAGAGTTTGCTGGCATAAACCGCGGAATGGAGAAAEST: gi|18848595|gb|BM567752.1|BM567752
genomic: TTGGAAGTGTATTGGGACAAAGCATAGCTCTGGATTATTTTGTCTCACAGgttaatatgt ... tcattatcagGTTGATGGTTTAGTTGAAGAGTTTGCTGGCATAAATCGCGGAATGGAGAAA
EST: TTGGAAGTGTATTGGGACAAAGCATAGCTCTGGATTATTTTGTCTCACAG GTTGATGGTTTAGTTGAAGAGTTTGCTGGCATAAATCGCGGAATGGAGAAAEST: gi|193593283|gb|FK545801.1|FK545801
genomic: TTGGAAGTGTATTGGGACAAAGCATAGCTCTGGATTATTTTGTCTCACAGgttaatatgt ... tcattatcagGTTGATGGTTTAGTTGAAGAGTTTGCTGGCATAAATCGCGGAATGGAGAAA
EST: TTGGAAGTGTATTGGGACAAAGCATAGCTCTGGATTATTTTGTCTCACAG GTTGATGGTTTAGTTGAAGAGTTTGCTGGCATAAACCGCGGAATGGAGAAAEST: gi|192321870|gb|FK013234.1|FK013234
genomic: TTGGAAGTGTATTGGGACAAAGCATAGCTCTGGATTATTTTGTCTCACAGgttaatatgt ... tcattatcagGTTGATGGTTTAGTTGAAGAGTTTGCTGGCATAAATCGCGGAATGGAGAAA
EST: TTGGAAGTGTATTGGGACAA-GCATAGCTCTGGATTATTT-GTCTCACAG -TTGATGGTTTAGTTGAAGAGTTTGCTGGCATAA-TCGCGGA-TGGAGAAEST: gi|254324255|gb|GR840572.1|GR840572
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EST: TTGGAAGTGTATTGGGACAAAGCATAGCTCTGGATTATTTTGTCTCACAG GTTGATGGTTTAGTTGAAGAGTTTGCTGGCATAAATCGCGGAATG-AGAAAEST: gi|254324256|gb|GR840573.1|GR840573
genomic: TTGGAAGTGTATTGGGACAAAGCATAGCTCTGGATTATTTTGTCTCACAGgttaatatgt ... tcattatcagGTTGATGGTTTAGTTGAAGAGTTTGCTGGCATAAATCGCGGAATGGAGAAA
EST: TTGGAAGTGTATTGGGACAAAGCATAGCTCTGGATTATTTTGTCTCACAG GTTGATGGTTTAGTTGAAGAGTTTGCTGGCATAAATCGCGGAATGGAGAAAEST: gi|192321869|gb|FK013233.1|FK013233
genomic: TTGGAAGTGTATTGGGACAAAGCATAGCTCTGGATTATTTTGTCTCACAGgttaatatgt ... tcattatcagGTTGATGGTTTAGTTGAAGAGTTTGCTGGCATAAATCGCGGAATGGAGAAA
EST: TTGGAAGTGTATTGGGACAAAGCATAGCTCTGGATTATTTTGTCTCACAG GTTGATGGTTTAGTTGAAGAGTTTGCTGGCATAAATCGCGGAATGGAGAAAEST: gi|22930913|gb|BU548052.1|BU548052
genomic: TTGGAAGTGTATTGGGACAAAGCATAGCTCTGGATTATTTTGTCTCACAGgttaatatgt ... tcattatcagGTTGATGGTTTAGTTGAAGAGTTTGCTGGCATAAATCGCGGAATGGAGAAA
EST: NNNGAAGTGTATTGGGACAAAGCATAGCTCTGGATTATTTTGTCTCACAG GTTGATGGTTTAGTTGAAGAGTTTGCTGGCATAAATCGCGGAATGGAGAAA
genomic: TTGGAAGTGTATTGGGACAAAGCATAGCTCTGGATTATTTTGTCTCACAGgttaatatgt ... tcattatcagGTTGATGGTTTAGTTGAAGAGTTTGCTGGCATAAATCGCGGAATGGAGAAA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TCCAGACTACATAGTTCTGAAATCGTTGGATACTGATGGTATCCGTATAATTGGAAGTGTATTGGGACAAAGCATAGCTCTGGATTATTTTGTCTCACAGgttaatatgtgccaaatgtcatcttctttccagtactttgttggccatttgttaccctgaaggaaaaagacaacccttaaactgaagccgttaatttttattttaaaagaagccattgactttttggcatttgctctctctcattatcag
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