Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   		19  
 5'  3'   		20  
 5'  3'   
21  
 5'  3'   		22  
 5'  3'   		23  
 5'  3'   		24  
 5'  3'   		25  
 5'  3'   		26  
 5'  3'   		27  
 5'  3'   		28  
 5'  3'   		29  
 5'  3'   		30  
 5'  3'   		31  
 5'  3'   		32  
 5'  3'   		33  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

AGAGCCTGATACCAAGAATGAGGAGAGTCCTTTGCTGGTAACTGTCAGGGGAAAGTGCATTACACAGTTATTGCTTCTTGGTGCAATTGATGGTATTCAGgtttgtatgtttatatcttttctatgttcagatctcacatttttaggtttccctaaatttgtgtgttaaaaaaggtttgtaacccgaaaagttttcaagg...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA13G17610.1
intron # 30
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|298185279|gb|HO030492.1|HO030492
EST:     GAAAGTGCATTACACAGTTATTGCTTCTTGGTGCAATTGACGGTATTCAG                         AAGAAATACTGGACAAAATTAAAATCCCAACAGAAGGTTTCTATAATGGAC
genomic: GAAAGTGCATTACACAGTTATTGCTTCTTGGTGCAATTGATGGTATTCAGgtttgtatgt ... ttatttgcagAAGAAATACTGGACAAAATTAAAATCCCAACAGAAGGTTTCTATAATGGAC