Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   		19  
 5'  3'   		20  
 5'  3'   
21  
 5'  3'   		22  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTTGCGACGAAGTACCCTGCAAATGCCTTGCCGCATCGCCCAACATTACTACAGTACATTGTCTCGTTAAAGgttgccgtcttatgtcatatgattggcatatagtgatactaagattttagatgaagttttagcatccattttttcccctcttactaagattattctcgcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA20G25120.1
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|213595095|gb|DB972029.1|DB972029
EST:     ATGCCTTGCCGCATCGCCCAACATTACTACAGTACATTGTCTCGTTAAAG                         GTGAAAACAACTGCCCAGTTAGATGCAGCATTATCATTTCTTGCTACCACA
genomic: ATGCCTTGCCGCATCGCCCAACATTACTACAGTACATTGTCTCGTTAAAGgttgccgtct ... attctcgcagGTGAAAACAACTGCCCAGTTAGATGCAGCATTATCATTTCTTGCTACCACA
EST: gi|209726982|gb|BW680301.1|BW680301
EST:     ATGCCTTGCCGCATCGCCCAACATTACTACAGTACATTGTCTCGTTAAAG                         GTGAAAACAACTGCCCAGTTAGATGCAGCATTATCATTTCTTGCTACCACA
genomic: ATGCCTTGCCGCATCGCCCAACATTACTACAGTACATTGTCTCGTTAAAGgttgccgtct ... attctcgcagGTGAAAACAACTGCCCAGTTAGATGCAGCATTATCATTTCTTGCTACCACA