1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
TTGGACTTGTATCTATTGTCCCAAAAATGGAAGGAGCTAGTGGAAAAAGCTCGTGCAAAGCAGTTGCAACCTCATGAGTATAATTCAGgtgtctttatgaattgtgattgttgtttgttattagcaaaaaaaaatttcgttgaacttgggtgttttaattttgacccaaatttaattgtgcctgctacag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA20G24830.2 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
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EST: AGTGGAAAAAGCTCGTGCAAAGCAGTTGCAACCTCATGAGTATAATTCAG GAACTTTCACGCTTTCCAATTTGGGTATGTTTGGAGTTGACAGGTTTGATGEST: gi|193489031|gb|FK456728.1|FK456728
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EST: AGTGGAAAAAGCTCGTGCAAAGCAGTTGCAACCTCATGAGTATAATTCAG GAACTTTCACGCTEST: gi|208054335|gb|GD854472.1|GD854472
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EST: AAAGCTCGTGCAAAGCAGTTTGCAACCTCATGAGTATAATTCAG GAACTTTCACGCTTTCCAATTTGGGTATGTTTGGAGTTGACAGGTTTGATGEST: gi|31466163|gb|CD408191.1|CD408191
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atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TTGGACTTGTATCTATTGTCCCAAAAATGGAAGGAGCTAGTGGAAAAAGCTCGTGCAAAGCAGTTGCAACCTCATGAGTATAATTCAGgtgtctttatgaattgtgattgttgtttgttattagcaaaaaaaaatttcgttgaacttgggtgttttaattttgacccaaatttaattgtgcctgctacag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGTGGA
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