1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
ACAAGGACTGGCTGTCTTTGGTTGCCGTTCACAGCGATGCATGGTTACTTGCAGTGGCTTTCTACTTTGGGGCACGATTTGGTTTTGATAATGCTGACAGgtataattatgttttctaaccctttattgtgtgttttttcacgcaattgatctctaggttggacaaggaaattttttggatgcctatcatttttcattta...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA17G05940.2 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GCAGTGGCTTTCTACTTTGGGGCACGATTTGGTTTTGATAATGCTGACAG GAAACGCCTGTTCTCTATGATTAATGATTTACCAACAATATTTGAGATTGTEST: gi|207715433|gb|GD695651.1|GD695651
genomic: GCAGTGGCTTTCTACTTTGGGGCACGATTTGGTTTTGATAATGCTGACAGgtataattat ... gtctttgcagGAAACGCCTGTTCTCTATGATTAATGATTTACCAACAATATTTGAGATTGT
EST: GCAGTGGCTTTCTACTTTGGGGCACGATTTGGTTTTGATAATGCTGACAG GAAACGCCTGTTCTCTATGATTAATGATTTACCAACAATATTTGAGATTGTEST: gi|26048084|gb|CA784679.1|CA784679
genomic: GCAGTGGCTTTCTACTTTGGGGCACGATTTGGTTTTGATAATGCTGACAGgtataattat ... gtctttgcagGAAACGCCTGTTCTCTATGATTAATGATTTACCAACAATATTTGAGATTGT
EST: GCAGTGGCTTTCTACTTTGGGGCACGATTTGGTTTTGATAATGCTGACAG GAAACGCCTGTTCTCTATGATTAATGATTTACCAACAATATTTGAGATTGTEST: gi|192312490|gb|FK003226.1|FK003226
genomic: GCAGTGGCTTTCTACTTTGGGGCACGATTTGGTTTTGATAATGCTGACAGgtataattat ... gtctttgcagGAAACGCCTGTTCTCTATGATTAATGATTTACCAACAATATTTGAGATTGT
EST: GCAGTGGCTTTCTACTTTGGGGCACGATTTGGTTTTGATAATGCTGACAG GAAACGCCTGTTCTCTATGATTAATGATTTACCAACAATATTTGAGATTGTEST: gi|6846794|gb|AW349084.1|AW349084
genomic: GCAGTGGCTTTCTACTTTGGGGCACGATTTGGTTTTGATAATGCTGACAGgtataattat ... gtctttgcagGAAACGCCTGTTCTCTATGATTAATGATTTACCAACAATATTTGAGATTGT
EST: GCAGTGGCTTNNNACTTTGGGGCACGATTTGGTTTTGATAATGCTGACAG GAAACGCCTGTTCTCTATGATTAATGATTTACCAACAATATTTGAGATTGT
genomic: GCAGTGGCTTTCTACTTTGGGGCACGATTTGGTTTTGATAATGCTGACAGgtataattat ... gtctttgcagGAAACGCCTGTTCTCTATGATTAATGATTTACCAACAATATTTGAGATTGT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ACAAGGACTGGCTGTCTTTGGTTGCCGTTCACAGCGATGCATGGTTACTTGCAGTGGCTTTCTACTTTGGGGCACGATTTGGTTTTGATAATGCTGACAGgtataattatgttttctaaccctttattgtgtgttttttcacgcaattgatctctaggttggacaaggaaattttttggatgcctatcatttttcattta
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ATGCTG