Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TTGTTGGCATTGCAACCATTGCAAACACGGTCGATATAACTTATGCGATGATATGAAGTTTTTTGCTACTCCACCAGTTCATGGTTCCCTGGCTAATCAGgtttgaaacaattcacttctcagagtattattctttcagtcatgtgcaactggaagtatacttggcttttctaaataattagaattcgaaagaaacaatg...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA16G32360.1
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|192322661|gb|FK014998.1|FK014998
EST:     ATATGAAGTTTTTTGCTACTCCACCAGTTCATGGTTCCCTGGCTAATCAG                         ATAGTGCATCCTGCAGACCTATGTTTTAAGCTGCCAGACAACGTGAGCCTA
genomic: ATATGAAGTTTTTTGCTACTCCACCAGTTCATGGTTCCCTGGCTAATCAGgtttgaaaca ... ctctttacagATAGTGCATCCTGCAGACCTATGTTTTAAGCTGCCAGACAACGTGAGCCTA
EST: gi|213620089|gb|DB965395.1|DB965395
EST:     ATATGAAGTTTTTTGCTACTCCACCAGTTCATGGTTCCCTGGCTAATCAG                         ATAGTGCATCCTGCAGACCTATGTTTTAAGCTGCCAGACAACGTGAGCCTA
genomic: ATATGAAGTTTTTTGCTACTCCACCAGTTCATGGTTCCCTGGCTAATCAGgtttgaaaca ... ctctttacagATAGTGCATCCTGCAGACCTATGTTTTAAGCTGCCAGACAACGTGAGCCTA
EST: gi|151395176|gb|EV265047.1|EV265047
EST:     ATATGAAGTTTTTTGCTACTCCACCAGTTCATGGTTCCCTGGCTAATCAG                         ATAGTGCATCCTGCAGACCTATGTTTTAAGCTGCCAGACAACGTGAGCCTA
genomic: ATATGAAGTTTTTTGCTACTCCACCAGTTCATGGTTCCCTGGCTAATCAGgtttgaaaca ... ctctttacagATAGTGCATCCTGCAGACCTATGTTTTAAGCTGCCAGACAACGTGAGCCTA
EST: gi|6482005|gb|AW201276.1|AW201276
EST:     ATATGAAGTTTATTGCTACTCCACCAGTTCATGGTTCCCTGGCTAATCAG                         ATAGTGCATCCTGCAGACCTATGTTTTAAGCTGCCAGACAACGTGAGCCTA
genomic: ATATGAAGTTTTTTGCTACTCCACCAGTTCATGGTTCCCTGGCTAATCAGgtttgaaaca ... ctctttacagATAGTGCATCCTGCAGACCTATGTTTTAAGCTGCCAGACAACGTGAGCCTA
EST: gi|4287428|gb|AI441188.1|AI441188
EST:     ATATGAAGTTTTTTGCTACTCCACCAGTTCATGGTTCCCTGGCTAATCAG                         ATAGTGCATCCTGCAGACCTATGTTTTAAGCTGCCAGACAACGTGAGCCTA
genomic: ATATGAAGTTTTTTGCTACTCCACCAGTTCATGGTTCCCTGGCTAATCAGgtttgaaaca ... ctctttacagATAGTGCATCCTGCAGACCTATGTTTTAAGCTGCCAGACAACGTGAGCCTA
EST: gi|213605714|gb|DB972334.1|DB972334
EST:     ATATGAAGTTTTTTGCTACTCCACCAGTTCATGGTTCCCTGGCTAATCAG                         ATAGTGCATCCTGCAGACCTATGTTTTAAGCTGCCAGACNACGTGAGCCTA
genomic: ATATGAAGTTTTTTGCTACTCCACCAGTTCATGGTTCCCTGGCTAATCAGgtttgaaaca ... ctctttacagATAGTGCATCCTGCAGACCTATGTTTTAAGCTGCCAGACAACGTGAGCCTA