Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TGGGATGAGGCTAATATTGGAGAAATTGAGGCAAACAAACCTGTGAGGCAGAAAATTACTGAGCCTAAGACTCCATATCATCCTATGATTGATGATGACAgtatgtaaagatcacttaaactttatgtttctatttaattaagtctgcatgtatgggtatatggctatgtatacaaataatcttctgattttattttaag...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA16G31990.2
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|151400975|gb|EV270789.1|EV270789
EST:     GAAAATTACTGAGCCTAAGACTCCATATCATCCTATGATTGATGATGACA                         GTTCTCTATCCCCTGTACGAGGAAGTTTTGATGCATGTATTGATGATCAAA
genomic: GAAAATTACTGAGCCTAAGACTCCATATCATCCTATGATTGATGATGACAgtatgtaaag ... atttttctagGTTCTCTATCCCCTGTACGAGGAAGTTTTGATGCATGTATTGATGATCAAA
EST: gi|151410315|gb|EV280130.1|EV280130
EST:     GAAAATTACTGAGCCTAAGACTCCATATCATCCTATGATTGATGATGACA                         GTTCTCTATCCCCTGTACGAGGAAGTTTTGATGCATGTATTGATGATCAAA
genomic: GAAAATTACTGAGCCTAAGACTCCATATCATCCTATGATTGATGATGACAgtatgtaaag ... atttttctagGTTCTCTATCCCCTGTACGAGGAAGTTTTGATGCATGTATTGATGATCAAA
EST: gi|298187321|gb|HO034470.1|HO034470
EST:     GAAAATTACTGAGCCTAAGACTCCATATCATCCTATGATTGATGATGACA                         GTTCTCTATCCCCTGTACGAGGAAGTTTTGATGCATGTATTGATGATCAAA
genomic: GAAAATTACTGAGCCTAAGACTCCATATCATCCTATGATTGATGATGACAgtatgtaaag ... atttttctagGTTCTCTATCCCCTGTACGAGGAAGTTTTGATGCATGTATTGATGATCAAA
EST: gi|19934517|gb|BQ079547.1|BQ079547
EST:     GAAAATTACTGAGCCTAAGACTCCATATCATCCTATGATTGATGATGACA                         GTTCTCTATCCCCTGTACGAGGAAGTTTTGATGCATGTATTGATGATCAAA
genomic: GAAAATTACTGAGCCTAAGACTCCATATCATCCTATGATTGATGATGACAgtatgtaaag ... atttttctagGTTCTCTATCCCCTGTACGAGGAAGTTTTGATGCATGTATTGATGATCAAA
EST: gi|192328311|gb|FK020022.1|FK020022
EST:     GAAAATTACTGAGCCTAAGACTCCATATCATCCTATGATTGATGATGACA                         GTTCTCTATCCCCTGTACGAGGAAGTTTTGATGCATGTATTGATGATCAAA
genomic: GAAAATTACTGAGCCTAAGACTCCATATCATCCTATGATTGATGATGACAgtatgtaaag ... atttttctagGTTCTCTATCCCCTGTACGAGGAAGTTTTGATGCATGTATTGATGATCAAA
EST: gi|151398424|gb|EV268295.1|EV268295
EST:     GAAAATTACTGAGCCTAAGACTCCATATCATCCTATGATTGATGATGACA                         GTTCTCTATCCCCTGTACGAGGAAGTTTTGATGCATGTATTGATGATCAAA
genomic: GAAAATTACTGAGCCTAAGACTCCATATCATCCTATGATTGATGATGACAgtatgtaaag ... atttttctagGTTCTCTATCCCCTGTACGAGGAAGTTTTGATGCATGTATTGATGATCAAA