1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
TATGGGTGTTGGTGTTTGCACTGTTACTGATGTGAGTGTTAACGGAAGAGGATTCATTGCTGCCTTTGTAGCAGTATGGAGCACTTCTATGCAACAATATgtacgtatgactttcctctgcgtgccatggcttggccttcaaatttaagtggcacagtaaactcaaatagatttaaatacagacacgaacagatgcatgt...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA16G27820.1 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GATTCATTGCTGCCTTTGTAGCAGTATGGAGCACTTCTATGCAACAATAT TATGTTCATTTCCTTCAACGGAAGTATTCTCTAAGTTCTTTCAATCTATTGEST: gi|13181556|gb|BG352896.1|BG352896
genomic: GATTCATTGCTGCCTTTGTAGCAGTATGGAGCACTTCTATGCAACAATATgtacgtatga ... ttatgtgcagTATGTTCATTTCCTTCAACGGAAGTATTCTCTAAGTTCTTTCAATCTATTG
EST: GATTCATTGCTGCCTTTGTAGCAGTATGGAGCACTTCTATGCAACAATAT TATGTTCATTTCCTTCAACGGAAGTATTCTCTAAGTTCTTTCAATCTATTGEST: gi|9258611|gb|BE346758.1|BE346758
genomic: GATTCATTGCTGCCTTTGTAGCAGTATGGAGCACTTCTATGCAACAATATgtacgtatga ... ttatgtgcagTATGTTCATTTCCTTCAACGGAAGTATTCTCTAAGTTCTTTCAATCTATTG
EST: TGGAGCACTTCTATGCAACAATAT TATGTTCATTTCCTTCAACGGAAGTATTCTCTAAGTTCTTTCAATCTATTG
genomic: TGGAGCACTTCTATGCAACAATATgtacgtatga ... ttatgtgcagTATGTTCATTTCCTTCAACGGAAGTATTCTCTAAGTTCTTTCAATCTATTG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TATGGGTGTTGGTGTTTGCACTGTTACTGATGTGAGTGTTAACGGAAGAGGATTCATTGCTGCCTTTGTAGCAGTATGGAGCACTTCTATGCAACAATATgtacgtatgactttcctctgcgtgccatggcttggccttcaaatttaagtggcacagtaaactcaaatagatttaaatacagacacgaacagatgcatgt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGCA