1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
GACAATCCCATTTGCCTGGAATCTCATCACAGCTGGTTATGTTGAACAATCTATATATGGGgtatgcacatgctgttttttgaactcactattcatatttcattgtattaccagagttgtaaatcttgcttacaagaaaacttcacaattaacatggtttgtacaattttatag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA16G26110.1 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TTGCCTGGAATCTCATCACAGCTGGTTATGTTGAACAATCTATATATGGG GTAGTGGTCAGCACATTAAGTCTCCTGTTTATTGNGAAGCTGCTTGAACCAEST: gi|192295151|gb|FG986870.1|FG986870
genomic: TTGCCTGGAATCTCATCACAGCTGGTTATGTTGAACAATCTATATATGGGgtatgcacat ... aattttatagGTAGTGGTCAGCACATTAAGTCTCCTGTTTATTGGGAAGCTGCTTGAACCA
EST: TTGCCTGGAATCTCATCACAGCTGGTTATGTTGAACAATCTATATATGGG GTAGTGGTCAGCACATTAAGTCTCCTGTTTATTGGGAAGCTGCTTGAACCAEST: gi|17022945|gb|BM093979.1|BM093979
genomic: TTGCCTGGAATCTCATCACAGCTGGTTATGTTGAACAATCTATATATGGGgtatgcacat ... aattttatagGTAGTGGTCAGCACATTAAGTCTCCTGTTTATTGGGAAGCTGCTTGAACCA
EST: TTGCCTGGAATCTCATCACAGCTGGTTATGTTGAACAATCTATATATGGG GTAGTGGTCAGCACATTAAGTCTCCTGTTTATTGGGAAGCTGCTTGAACCAEST: gi|193484251|gb|FK448577.1|FK448577
genomic: TTGCCTGGAATCTCATCACAGCTGGTTATGTTGAACAATCTATATATGGGgtatgcacat ... aattttatagGTAGTGGTCAGCACATTAAGTCTCCTGTTTATTGGGAAGCTGCTTGAACCA
EST: TTGCCTGGAATCTCATCACAGCTGGTTATGTTGAACAATCTATATATGGG GTAGTGGTCAGCACATTAAGTCTCCTGTTTATTGGGAAGCTGCTTGAACCAEST: gi|15203857|gb|BI426625.1|BI426625
genomic: TTGCCTGGAATCTCATCACAGCTGGTTATGTTGAACAATCTATATATGGGgtatgcacat ... aattttatagGTAGTGGTCAGCACATTAAGTCTCCTGTTTATTGGGAAGCTGCTTGAACCA
EST: TTGCCTGGAATCTCATCACAGCTGGTTATGTTGAACAATCTATATATGGG GTAGTGGTCAGCACATTAAGTCTCCTGTTTATTGGGAAGCTGCTTGAACCAEST: gi|6501861|gb|AW203220.1|AW203220
genomic: TTGCCTGGAATCTCATCACAGCTGGTTATGTTGAACAATCTATATATGGGgtatgcacat ... aattttatagGTAGTGGTCAGCACATTAAGTCTCCTGTTTATTGGGAAGCTGCTTGAACCA
EST: TTGCCTGGAATCTCATTACAGCTGGATATGTTGAACAATCTATATATGGG GTAGTGGTCAGCACATTAAGTCTCCTGTTTATTGGGAAGCTGCTTGAACCA
genomic: TTGCCTGGAATCTCATCACAGCTGGTTATGTTGAACAATCTATATATGGGgtatgcacat ... aattttatagGTAGTGGTCAGCACATTAAGTCTCCTGTTTATTGGGAAGCTGCTTGAACCA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GACAATCCCATTTGCCTGGAATCTCATCACAGCTGGTTATGTTGAACAATCTATATATGGGgtatgcacatgctgttttttgaactcactattcatatttcattgtattaccagagttgtaaatcttgcttacaagaaaacttcacaattaacatggtttgtacaattttatag
- - - - - - - - - - - - - - CAGCTG