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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GAACTTTATGGACCTTCTGTTGTCCCCAGCTTCTAAGGTTTTGAACAACTGGTTTGAGgtaatcttatggttttaaattttaattgcttttcatttagatcttcaacctcaaagttcaaactctctgactttatctcttaaaattgaacatatcttct...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA16G25390.1
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA16G25390.1 (Glycine max), 5'ss of exon 3
lower sequence: Vv04s0023g01790.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 4
GAACTTTATGGACCTTCTGTTGTCCCCAGCTTCTAAGGTTTTGAACAACTGGTTTGAGgtaatcttatggttttaaattttaattgcttttcatttagatcttcaacctcaaagttcaaactctctgactttatctc-ttaaaattgaacatatcttct--
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GGACTTTGTGGACCTTCTGTTGTCCCCAACTTCAAAGGTTTTGAACTACTGGTTTGAGgttgtcatattatcttaa---tcactttgtttaatcatagacttacattgtttttgttgctaggttgagatgttggatgattggaatagcattggtaatgaaa