Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CTTCGAGTTTCTAGACTATTTCCGGATTCCTGATGGACCAATTTTCTTGGTAATCGGTGGTGAAGGTCCATGTAATGGGATAACAAATGACTATATTGGTgtaagttgcaacccttggtccaaatttttgttattgattaagcaactcttgatttcaagactcaataccaaatattgtaagatcataagttttggcacca...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA16G24270.1
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|298172950|gb|HO019934.1|HO019934
EST:     TAATCGGTGGTGAAGGTCCATGTAATGGGATAACAAATGACTATATTGGT                         GTACTGGCAAAGAAGTTTGGAGCAGCTATGGTTACTCTTGAACATCGCTAC
genomic: TAATCGGTGGTGAAGGTCCATGTAATGGGATAACAAATGACTATATTGGTgtaagttgca ... ttctctatagGTACTGGCAAAGAAGTTTGGAGCAGCTATGGTTACTCTTGAACATCGCTAC
EST: gi|13252300|gb|BG363203.1|BG363203
EST:     TAATCGGTGGTGAAGGTCCATGTAATGGGATAACAAATGACTATATTGGT                         GTACTGGCAAAGAAGTTTGGAGCAGCTATGGTTACTCTTGAACATCGCTAC
genomic: TAATCGGTGGTGAAGGTCCATGTAATGGGATAACAAATGACTATATTGGTgtaagttgca ... ttctctatagGTACTGGCAAAGAAGTTTGGAGCAGCTATGGTTACTCTTGAACATCGCTAC
EST: gi|192307849|gb|FG999328.1|FG999328
EST:     TAATCGGTGGTGAAGGTCCATGTAATGGGATAACAAATGACTATATTGGT                         GTACTGGCAAAGAAGTTTGGAGCAGCTATGGTTACTCTTGAACATCGCTAC
genomic: TAATCGGTGGTGAAGGTCCATGTAATGGGATAACAAATGACTATATTGGTgtaagttgca ... ttctctatagGTACTGGCAAAGAAGTTTGGAGCAGCTATGGTTACTCTTGAACATCGCTAC
EST: gi|192303244|gb|FG995580.1|FG995580
EST:     TAATCGGTGGTGAAGGTCCATGTAATGGGATAACAAATGACTATATTGGT                         GTACTGGCAAAGAAGTTTGGAGCAGCTATGGTTACTCTTGAACATCGCTAC
genomic: TAATCGGTGGTGAAGGTCCATGTAATGGGATAACAAATGACTATATTGGTgtaagttgca ... ttctctatagGTACTGGCAAAGAAGTTTGGAGCAGCTATGGTTACTCTTGAACATCGCTAC
EST: gi|151399803|gb|EV269674.1|EV269674
EST:     TAATCGGTGGTGAAGGTCCATGTAATGGGATAACAAATGACTATATTGGT                         GTACTGGCAAAGAATTTTGGAGCAGCTATGGTTACTCTTGAACATCGCTAC
genomic: TAATCGGTGGTGAAGGTCCATGTAATGGGATAACAAATGACTATATTGGTgtaagttgca ... ttctctatagGTACTGGCAAAGAAGTTTGGAGCAGCTATGGTTACTCTTGAACATCGCTAC
EST: gi|7232689|gb|AW568043.1|AW568043
EST:     TAATCGGTGGTGAAGGTCCATGTAATGGGATAACAAATGACTATATTGGT                         GTACTGGCAAAGAAGTNTGGAGCAGCTATGGTTACTCTTGAACATCGCTAC
genomic: TAATCGGTGGTGAAGGTCCATGTAATGGGATAACAAATGACTATATTGGTgtaagttgca ... ttctctatagGTACTGGCAAAGAAGTTTGGAGCAGCTATGGTTACTCTTGAACATCGCTAC