1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
TACAGTTGAAGATAACATTCTCATCAGTTTAGAGAAACCAAAATGGCTTATTGCAATGGCTAATATGTTTGTTGTGATCCATGTTATTGGAAGTTATCAGgtgaaattcagtttctcttactcttgtccattatccaaaacccttttgattttagcatcaccctttctttttggttcaaaaaacagaagtcatcaagagtaactcttttttttttttttttttgtag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA16G06750.1 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TTGCAATGGCTAATATGTTTG-TGTGATCCATGTTA-TGGAAGTTATCAG ATTTATGCAATGCCAGTG-TTGACATGATTGAAACTGTGATGGTGAAGAAAEST: gi|105632108|gb|DW246312.1|DW246312
genomic: TTGCAATGGCTAATATGTTTGTTGTGATCCATGTTATTGGAAGTTATCAGgtgaaattca ... ttttttgtagATTTATGCAATGCCAGTGTTTGACATGATTGAAACTGTGATGGTGAAGAAA
EST: TTGCAATGGCTAATATGTTTGTGGTGATCCATGTTATTGGAAGTTATCAG ATTTATGCAATGCCAGTGTTTGACATGATTGAAACTGTGATGGTGAAGAAEST: gi|254330083|gb|GR839636.1|GR839636
genomic: TTGCAATGGCTAATATGTTTGTTGTGATCCATGTTATTGGAAGTTATCAGgtgaaattca ... ttttttgtagATTTATGCAATGCCAGTGTTTGACATGATTGAAACTGTGATGGTGAAGAA
EST: TTGCAATGGCTAATATGTTTGTTGTGATCCATGTTATTGGAAGTTATCAG ATTTATGCAATGCCAGTGTTTGACATGATTGAA-CTGTGATGGTGAAGAAAEST: gi|254343288|gb|GR856992.1|GR856992
genomic: TTGCAATGGCTAATATGTTTGTTGTGATCCATGTTATTGGAAGTTATCAGgtgaaattca ... ttttttgtagATTTATGCAATGCCAGTGTTTGACATGATTGAAACTGTGATGGTGAAGAAA
EST: TTGCAATGGCTAATATGTTTGTTGTGATCCATGTTATTGGAAGTTATCAG ATTTATGCAATGCCAGTGTTTGACATGATTGAAACTGTGATGGTGAAGAAAEST: gi|254343289|gb|GR856993.1|GR856993
genomic: TTGCAATGGCTAATATGTTTGTTGTGATCCATGTTATTGGAAGTTATCAGgtgaaattca ... ttttttgtagATTTATGCAATGCCAGTGTTTGACATGATTGAAACTGTGATGGTGAAGAAA
EST: TTGCAATGGCTAATATG-TTGTTGTGATCCATGTTATTGGAAGTTATCAG ATTTATGCAATGCCAGTGTTTGACATGATTGAAACTGTGATGGTGAAGAAAEST: gi|105633568|gb|DW246931.1|DW246931
genomic: TTGCAATGGCTAATATGTTTGTTGTGATCCATGTTATTGGAAGTTATCAGgtgaaattca ... ttttttgtagATTTATGCAATGCCAGTGTTTGACATGATTGAAACTGTGATGGTGAAGAAA
EST: TTGCAATGGCTAATATGTTTGTGGTGATCCATGTTATTGGAAGTTATCAG ATTTATGCAATGCCAGTGTTTGACATGATTGAAACTGTGATGGTGAAGAAG
genomic: TTGCAATGGCTAATATGTTTGTTGTGATCCATGTTATTGGAAGTTATCAGgtgaaattca ... ttttttgtagATTTATGCAATGCCAGTGTTTGACATGATTGAAACTGTGATGGTGAAGAAA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TACAGTTGAAGATAACATTCTCATCAGTTTAGAGAAACCAAAATGGCTTATTGCAATGGCTAATATGTTTGTTGTGATCCATGTTATTGGAAGTTATCAGgtgaaattcagtttctcttactcttgtccattatccaaaacccttttgattttagcatcaccctttctttttggttcaaaaaacagaagtcatcaagagtaactcttttttttttttttttttgtag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAAG