1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
AGTTTCTGCAGTGGCCATAAAGAATGTGACAATAAATGACAACTTCTTTCCTGGACATTTTCCAGAAAGGCCAATCATGCCTGGTGTTCTAATGGTCGAGgtactaaactatacactgtgctgcttgctgcctgcccctacctttattatatctctaattattttgtccttttcttgtctctaaacatgttatggtaaaa...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA15G05800.1 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CTGGACATTTTCCAGAAAGGCCAATCATGCCTGGTGTTCTAATGGTCGAG GCA-TGGCACAAGTTGGTGGTTTGGTCATGTTGCAACCTGAAGTGEST: gi|208121820|gb|GD918549.1|GD918549
genomic: CTGGACATTTTCCAGAAAGGCCAATCATGCCTGGTGTTCTAATGGTCGAGgtactaaact ... tttgctgcagGCAATGGCACAAGTTGGTGGTTTGGTCATGTTGCAACCTGAAGTG
EST: GGTGTTCTAATGGTTGAG GCAATGGCACAAGTTGGTGGTTTGGTCATGTTGCAACCTGAAGTGGGAGGCEST: gi|192315816|gb|FK008526.1|FK008526
genomic: GGTGTTCTAATGGTCGAGgtactaaact ... tttgctgcagGCAATGGCACAAGTTGGTGGTTTGGTCATGTTGCAACCTGAAGTGGGAGGT
EST: CTGGACATTTTCCAGGAAGGCCAATCATGCCTGGTGTTCTAATGGTCGAG GCAATGGCACAAGTTGGTGGTTTGGTCATGTTGCAACCTGAAGTGGGAGGTEST: gi|16277896|gb|BI942619.1|BI942619
genomic: CTGGACATTTTCCAGAAAGGCCAATCATGCCTGGTGTTCTAATGGTCGAGgtactaaact ... tttgctgcagGCAATGGCACAAGTTGGTGGTTTGGTCATGTTGCAACCTGAAGTGGGAGGT
EST: CTGGACATTTTCCAGAAAGGCCAATCATGCCTGGTGTTCTAATGGTCGAG GCAATGGCACAAGTTGGTGGTTTGEST: gi|192315817|gb|FK008527.1|FK008527
genomic: CTGGACATTTTCCAGAAAGGCCAATCATGCCTGGTGTTCTAATGGTCGAGgtactaaact ... tttgctgcagGCAATGGCACAAGTTGGTGGTTTG
EST: TGGACATTTTCCAGGAAAG-CCAATCATGCCTGGTGTTCTAATGGTCGAG GCAATGGCACAAGTTGGTGGTTTGGTCATGTTGCAACCTGAAGTGGGAG-TEST: gi|51344848|gb|CO985581.1|CO985581
genomic: TGGACATTTTCCAG-AAAGGCCAATCATGCCTGGTGTTCTAATGGTCGAGgtactaaact ... tttgctgcagGCAATGGCACAAGTTGGTGGTTTGGTCATGTTGCAACCTGAAGTGGGAGGT
EST: CTGGACATTTTCCAGAAAGGCCAATCATGCCTGGTGTTCTAATGGTCGAG GCAATGGCACAAGTTGGTGGTTTGGTCATGTTGCAACCTGAAGTGGGAGGTEST: gi|31310977|gb|CD396180.1|CD396180
genomic: CTGGACATTTTCCAGAAAGGCCAATCATGCCTGGTGTTCTAATGGTCGAGgtactaaact ... tttgctgcagGCAATGGCACAAGTTGGTGGTTTGGTCATGTTGCAACCTGAAGTGGGAGGT
EST: CTGGACATTTTCCAGAAAGGCCAATCATGCCTGGTGTTCTAATGGTCGAG GCAATGGCACAAGTTGGTGGTTTGGTCATGTTGCAACCTGAAGTGGGAGGTEST: gi|31464579|gb|CD406607.1|CD406607
genomic: CTGGACATTTTCCAGAAAGGCCAATCATGCCTGGTGTTCTAATGGTCGAGgtactaaact ... tttgctgcagGCAATGGCACAAGTTGGTGGTTTGGTCATGTTGCAACCTGAAGTGGGAGGT
EST: CTGGACATTTTCCAGAAAGGCCAATCATGCCTGGTGTTCTAATGGTCGAG GCAATGGCACAAGTTGGTGGTTTGGTCATGTTGCAACCTGAAGTGGGAGGTEST: gi|192333875|gb|FK025136.1|FK025136
genomic: CTGGACATTTTCCAGAAAGGCCAATCATGCCTGGTGTTCTAATGGTCGAGgtactaaact ... tttgctgcagGCAATGGCACAAGTTGGTGGTTTGGTCATGTTGCAACCTGAAGTGGGAGGT
EST: CTGGACATTTTCCAGAAAGGCCAATCATGCCTGGTGTTCTAATGGTCGAG GCAATGGCACAAGTTGGTGGTTTGGTCATGTTGCAACCTGAAGTGGGAGGT
genomic: CTGGACATTTTCCAGAAAGGCCAATCATGCCTGGTGTTCTAATGGTCGAGgtactaaact ... tttgctgcagGCAATGGCACAAGTTGGTGGTTTGGTCATGTTGCAACCTGAAGTGGGAGGT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| AGTTTCTGCAGTGGCCATAAAGAATGTGACAATAAATGACAACTTCTTTCCTGGACATTTTCCAGAAAGGCCAATCATGCCTGGTGTTCTAATGGTCGAGgtactaaactatacactgtgctgcttgctgcctgcccctacctttattatatctctaattattttgtccttttcttgtctctaaacatgttatggtaaaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ctgcccc