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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGCTGCGCCCTGATTTCCATGTTTCGGCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcctatttttttcttaaatatttttcatttgttcatgtgctctgcatttaatttattttggccaatggcttagttatcttcatgtgactatgt...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA15G04290.2
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA15G04290.1 (Glycine max), 5'ss of exon 3
lower sequence: Vv06s0004g04800.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 3
TGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGCTGCGCCCTGATTTCCATGTTTCGGCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcctatttttttcttaaatatttttcatttgttcatgtgctctgcatttaatttattttggccaatggcttagttatcttcatgtgactatgt-
|||| |||||| | |||||||||||  |  |  |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||  || |||||| | |||||||||   |||  | ||| || |   | |   |     |      | ||  | |  ||  || |  |      |||  |  |   ||   || |   | 
TGTTTCTTCCTTTGGTAAAAAGTTTATTAAGGTCTGATTTCCAAGTTGCGGCACAAAACTGTTGGATTCGGAGAGGAGGTGCTTTCACTGGTGAGATCAGgtatgtt-tttatactattcctataatctctgtttcaccgccctccttttggctgtccttggttgtcactgccatcttgctggttaacagtagattcatta
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|151402600|gb|EV272413.1|EV272413
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|298172150|gb|HO021742.1|HO021742
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|193713336|gb|FK654013.1|FK654013
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|192330567|gb|FK022698.1|FK022698
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|193533278|gb|FK491082.1|FK491082
EST:     GCACAAAACTGCTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|193623333|gb|FK577791.1|FK577791
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|209714947|gb|BW650793.1|BW650793
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|298167922|gb|HO013185.1|HO013185
EST:     GCACAAAACTGCTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|207770850|gb|GD743402.1|GD743402
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         CGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|193711039|gb|FK644726.1|FK644726
EST:     AAACTGTTGGGTTCGC-AAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: AAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|208251558|gb|GE049183.1|GE049183
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTT
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTT
EST: gi|207776286|gb|GD749607.1|GD749607
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|193665043|gb|FK612053.1|FK612053
EST:     CAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTGATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: CAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|208264221|gb|GE062563.1|GE062563
EST:     CGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: CGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|193696613|gb|FK640247.1|FK640247
EST:     TTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: TTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|208185737|gb|GD985358.1|GD985358
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|208048636|gb|GD846209.1|GD846209
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|33388216|gb|CA851423.1|CA851423
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|17020677|gb|BM091711.1|BM091711
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|193421524|gb|FK389655.1|FK389655
EST:     TTGGGTTCGC-AAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: TTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|19935084|gb|BQ080114.1|BQ080114
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|6455637|gb|AW186320.1|AW186320
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|298187234|gb|HO034383.1|HO034383
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|15203172|gb|BI425940.1|BI425940
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|213598487|gb|DB958127.1|DB958127
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|24205173|gb|BU964426.1|BU964426
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGAGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGCTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|208285272|gb|GE086030.1|GE086030
EST:     TGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: TGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|298197518|gb|HO044997.1|HO044997
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|298173782|gb|HO017118.1|HO017118
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|16997158|gb|BM086530.1|BM086530
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|208060615|gb|GD857055.1|GD857055
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAACGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|298195199|gb|HO043727.1|HO043727
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|193698321|gb|FK641520.1|FK641520
EST:     GGTGCTTNTACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|7326922|gb|AW620720.1|AW620720
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|298186175|gb|HO036808.1|HO036808
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|298182052|gb|HO026227.1|HO026227
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCTGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|207732803|gb|GD712232.1|GD712232
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTA
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTA
EST: gi|16346985|gb|BI972580.1|BI972580
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|193545109|gb|FK499878.1|FK499878
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGG
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGG
EST: gi|18735370|gb|BM528727.1|BM528727
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|7145629|gb|AW507551.1|AW507551
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|192325300|gb|FK019156.1|FK019156
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|208277072|gb|GE080785.1|GE080785
EST:     TTGGGTTCGC-AAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: TTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|9259762|gb|BE347909.1|BE347909
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|208239214|gb|GE040862.1|GE040862
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGGAATTCCTTGGGGTTATTATTGGTCAC
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EST: gi|298170923|gb|HO015899.1|HO015899
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genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|213601422|gb|DB968724.1|DB968724
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|18735273|gb|BM528669.1|BM528669
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|207705982|gb|GD687828.1|GD687828
EST:     AAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: AAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
EST: gi|208127399|gb|GD925803.1|GD925803
EST:     GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAG                         TGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC
genomic: GCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcc ... gcattaacagTGCTGAAATGCTTGTTAATTTGGGAATTCCTTGGGTTATTATTGGTCACTC

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
TGTTCCTTCCTGTTGTAAAAAGTTTGCTGCGCCCTGATTTCCATGTTTCGGCACAAAACTGTTGGGTTCGCAAAGGTGGTGCTTATACCGGTGAGGTTAGgtatgttgcctatttttttcttaaatatttttcatttgttcatgtgctctgcatttaatttattttggccaatggcttagttatcttcatgtgactatgt

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