1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
GAACTAAAATGCGCTATTGACCACATTTTGGATGCCCAGAGAAAAGGCGAGATCAACGAAGACAACGTCCTTTACATTGTTGAAAACATTAATGTCGCTGgtatgatgctttgccttgtatttctacccccacgacaagaaacaaacaaaaaatgataattatggtgcaggacacgtagagttactaaaattaattaaat...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA14G38580.1 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GATCAACGAAGACAACGTCCTTTACATTGTTGAAAACATTAATGTCGCTG CAATTGAGACAACTCTATGGTCGATTGAATGGGGCATTGCTGAGCTTGTGAEST: gi|192320877|gb|FK013071.1|FK013071
genomic: GATCAACGAAGACAACGTCCTTTACATTGTTGAAAACATTAATGTCGCTGgtatgatgct ... attatttcagCAATTGAGACAACTCTATGGTCGATTGAATGGGGCATTGCTGAGCTTGTGA
EST: ATTGTTGAAAACATTAATGTCGCTG CAATTGAGACAACTCTATGGTCGATTGAATGGGGCATTGCTGAGCTTGTGAEST: gi|254318383|gb|GR832551.1|GR832551
genomic: ATTGTTGAAAACATTAATGTCGCTGgtatgatgct ... attatttcagCAATTGAGACAACTCTATGGTCGATTGAATGGGGCATTGCTGAGCTTGTGA
EST: GATCAACGAAGACAACGTCCTTTACATTGTTGAAAACATTAATGTCGCTG CAATTGAGACAACTCTATGGTCGATTGAATGGGGCATTGCTGAGCTTGTGAEST: gi|37997489|gb|CF809078.1|CF809078
genomic: GATCAACGAAGACAACGTCCTTTACATTGTTGAAAACATTAATGTCGCTGgtatgatgct ... attatttcagCAATTGAGACAACTCTATGGTCGATTGAATGGGGCATTGCTGAGCTTGTGA
EST: GATCAACGAAGACAACGTCCTTTACATTGTTGAAAACATCAATGTCGCTG CAATTGAGACAACTCTATGGTCGATTGAATGGGGCATTGCTGAGCTTGTGAEST: gi|4286987|gb|AI441125.1|AI441125
genomic: GATCAACGAAGACAACGTCCTTTACATTGTTGAAAACATTAATGTCGCTGgtatgatgct ... attatttcagCAATTGAGACAACTCTATGGTCGATTGAATGGGGCATTGCTGAGCTTGTGA
EST: GATCAACGAAGACAACGTCCTTTACATTGTTGAAAACATTAATGTCGCTG CAATTGAGACAACTCTATGGTCGATTGAATGGGGCATTGCTGAGCTTGTGAEST: gi|37996475|gb|CF808064.1|CF808064
genomic: GATCAACGAAGACAACGTCCTTTACATTGTTGAAAACATTAATGTCGCTGgtatgatgct ... attatttcagCAATTGAGACAACTCTATGGTCGATTGAATGGGGCATTGCTGAGCTTGTGA
EST: GATCAACGAAGACAACGTCCTTTACATTGTTGAAAACATCAATGTCGCTG CAATTGAGACAACTCTATGGTCGATTGAATGGGGCATTGCTGAGCTTGTGAEST: gi|14126646|gb|BG791084.1|BG791084
genomic: GATCAACGAAGACAACGTCCTTTACATTGTTGAAAACATTAATGTCGCTGgtatgatgct ... attatttcagCAATTGAGACAACTCTATGGTCGATTGAATGGGGCATTGCTGAGCTTGTGA
EST: GATCAACGAAGACAACGTCCTTTACATTGTTGAAAACATCAATGTCGCTG CAATTGAGACAACTCTATGGTCGATTGAATGGGGCATTGCTGAGCTTGTGAEST: gi|4282941|gb|AI440594.1|AI440594
genomic: GATCAACGAAGACAACGTCCTTTACATTGTTGAAAACATTAATGTCGCTGgtatgatgct ... attatttcagCAATTGAGACAACTCTATGGTCGATTGAATGGGGCATTGCTGAGCTTGTGA
EST: GATCAACGAAGACAACGTCCTTTACATTGTTGAAAACATTAATGTCGCTG CAATTGAGACAACTCTATGGTCGATTGAATGGGGCATTGCTGAGCTTGTGAEST: gi|15664543|gb|BI701914.1|BI701914
genomic: GATCAACGAAGACAACGTCCTTTACATTGTTGAAAACATTAATGTCGCTGgtatgatgct ... attatttcagCAATTGAGACAACTCTATGGTCGATTGAATGGGGCATTGCTGAGCTTGTGA
EST: GATCAACGAAGACAACGTCCTTTACATTGTTGAAAACATTAATGTCGCTG CAATTGAGACAACTCTATGGTCGATTGAATGGGGCATTGCTGAGCTTGTGAEST: gi|37995343|gb|CF806932.1|CF806932
genomic: GATCAACGAAGACAACGTCCTTTACATTGTTGAAAACATTAATGTCGCTGgtatgatgct ... attatttcagCAATTGAGACAACTCTATGGTCGATTGAATGGGGCATTGCTGAGCTTGTGA
EST: GATCAACGAAGACAACGTCCTTTACATTGTTGAAAACATCAATGTCGCTG CAATTGAGACAACTCTATGGTCGATTGAATGGGGCATTGCTGAGCTTGTGAEST: gi|13311397|gb|BG405048.1|BG405048
genomic: GATCAACGAAGACAACGTCCTTTACATTGTTGAAAACATTAATGTCGCTGgtatgatgct ... attatttcagCAATTGAGACAACTCTATGGTCGATTGAATGGGGCATTGCTGAGCTTGTGA
EST: GATCAACGAAGACAACGTCCTTTACATTGTTGAAAACATTAATGTCGCTG CAATTGAGACAACTCTATGGTCGATTGAATGGGGCATTGCTGAGCTTGTGA
genomic: GATCAACGAAGACAACGTCCTTTACATTGTTGAAAACATTAATGTCGCTGgtatgatgct ... attatttcagCAATTGAGACAACTCTATGGTCGATTGAATGGGGCATTGCTGAGCTTGTGA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GAACTAAAATGCGCTATTGACCACATTTTGGATGCCCAGAGAAAAGGCGAGATCAACGAAGACAACGTCCTTTACATTGTTGAAAACATTAATGTCGCTGgtatgatgctttgccttgtatttctacccccacgacaagaaacaaacaaaaaatgataattatggtgcaggacacgtagagttactaaaattaattaaat
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CGAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ctacccc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - acaagaaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -aaacaaaa