Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTATTTTTTGAGAAAATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcacttctcaattttactagtatatttttgttcgtctcagaaatatcaattattgcactaaaatgagttgagcgctagttacttgttaaaaggatt...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA14G03380.1
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|298180231|gb|HO025446.1|HO025446
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|298178388|gb|HO024123.1|HO024123
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|298176066|gb|HO015471.1|HO015471
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAGAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|18690771|gb|BM519619.1|BM519619
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|298186560|gb|HO037193.1|HO037193
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAAAGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGGTTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|7590453|gb|AW706205.1|AW706205
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|298173141|gb|HO020125.1|HO020125
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|14259659|gb|BG882567.1|BG882567
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|298186019|gb|HO031180.1|HO031180
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|298176384|gb|HO023085.1|HO023085
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|298178730|gb|HO024465.1|HO024465
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|298193450|gb|HO033884.1|HO033884
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGGCAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAAAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|298185614|gb|HO030827.1|HO030827
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|192319176|gb|FK009116.1|FK009116
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGTAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|14259368|gb|BG882276.1|BG882276
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|19053812|gb|BM732479.1|BM732479
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGC
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|298190320|gb|HO032441.1|HO032441
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGTAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|298174887|gb|HO014804.1|HO014804
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|151404556|gb|EV274370.1|EV274370
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCGATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|298190823|gb|HO032944.1|HO032944
EST:     AATTGAAGAAGGTTAATAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATCAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|213606515|gb|DB958997.1|DB958997
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|208178558|gb|GD977055.1|GD977055
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|298167185|gb|HO010624.1|HO010624
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|298179498|gb|HO027969.1|HO027969
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|193649046|gb|FK597513.1|FK597513
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGG
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGG
EST: gi|213606584|gb|DB972519.1|DB972519
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|8827796|gb|BE211526.1|BE211526
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|16343137|gb|BI968732.1|BI968732
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|207726968|gb|GD702920.1|GD702920
EST:     CTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTT
genomic: CTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTT
EST: gi|193700425|gb|FK635054.1|FK635054
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGTTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTTGGCTGCG
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTT-GGCTGCG
EST: gi|213593001|gb|DB969855.1|DB969855
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|298184153|gb|HO029366.1|HO029366
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|6566138|gb|AW233777.1|AW233777
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|208185248|gb|GD981608.1|GD981608
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTA
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTA
EST: gi|298179381|gb|HO027852.1|HO027852
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|298166773|gb|HO010212.1|HO010212
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|13477996|gb|BG507649.1|BG507649
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGC
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|20815207|gb|BQ299685.1|BQ299685
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGC
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|151407956|gb|EV277771.1|EV277771
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|192333806|gb|FK025067.1|FK025067
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|298194938|gb|HO043410.1|HO043410
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|31462597|gb|CD404625.1|CD404625
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGC
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|192311868|gb|FK004513.1|FK004513
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|192311867|gb|FK004512.1|FK004512
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|298191318|gb|HO038797.1|HO038797
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAGGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|298180711|gb|HO022150.1|HO022150
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|193619369|gb|FK571237.1|FK571237
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTAT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTAT
EST: gi|298199015|gb|HO042378.1|HO042378
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|298183906|gb|HO029119.1|HO029119
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAACCAACAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|207758863|gb|GD732186.1|GD732186
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTA
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTA
EST: gi|207786059|gb|GD756184.1|GD756184
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|19053708|gb|BM732375.1|BM732375
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGTTTTATTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|298188212|gb|HO034905.1|HO034905
EST:     GATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGTGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|12691345|gb|BG157681.1|BG157681
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGG
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGG
EST: gi|151399793|gb|EV269664.1|EV269664
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
EST: gi|298165598|gb|HO011647.1|HO011647
EST:     AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAG                         ATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT
genomic: AATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcactt ... ctgattgcagATTTTTGAGAAGAATCCTACCAAGATTAAGAATTATGGAATTTGGCTGCGT

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
GTATTTTTTGAGAAAATTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAATGGACAAGTGCTAGCCATCAATGAGgtgtgcacttctcaattttactagtatatttttgttcgtctcagaaatatcaattattgcactaaaatgagttgagcgctagttacttgttaaaaggatt

- - - - - - - - TTGAAG
- - - - - - - -  TGAAGA
- - - - - - - - -  AAGAAG
- - - - - - - - - - - - - - AAGAAA
- - - - - - - - - - - - - - - -  AAGCAA