1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
TTACAAACTGGGTACTGGCTTGGTTGTTGCTCGAAGATCAGACGGATCATGGTCTGCACCGTCAGCAATATTCTCCCTGGGTTTAGGATGGGGTGCTCAGgtaaggaaaatatatactagtttagtttatctttagaattttgactatggttatgctcactgatatggtttgatagaaaaaatggagaaagaatatacca...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA13G17500.1 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GGTCTGCACCGTCAGCAATATTCTCCCTGGGTTTAGGATGGGGTGCTCAG ATTGGTGGTGAACTTATGGATTTTATAGTTGTTCTTCGTGATATGAAAGCTEST: gi|22933303|gb|BU550442.1|BU550442
genomic: GGTCTGCACCGTCAGCAATATTCTCCCTGGGTTTAGGATGGGGTGCTCAGgtaaggaaaa ... atattcccagATTGGTGGTGAACTTATGGATTTTATAGTTGTTCTTCGTGATATGAAAGCT
EST: GGNCTGCACCGTCAGCAATATTCTCCCTGGGTTTAGGATGGGGTGCTCAG ATTGGTGGTGAACTTATGGATTNNNTAGTTGTTCTTCGTGATATGAAAGCTEST: gi|192319363|gb|FK009905.1|FK009905
genomic: GGTCTGCACCGTCAGCAATATTCTCCCTGGGTTTAGGATGGGGTGCTCAGgtaaggaaaa ... atattcccagATTGGTGGTGAACTTATGGATTTTATAGTTGTTCTTCGTGATATGAAAGCT
EST: GGTCTGCACCGTCAGCAATATTCTCCCTGGGTTTAGGATGGGGTGCTCAG ATTGGTGGTGAACTTATGGATTTTATAGTTGTTCTTCGTGATATGAAAGCTEST: gi|15813292|gb|BI785567.1|BI785567
genomic: GGTCTGCACCGTCAGCAATATTCTCCCTGGGTTTAGGATGGGGTGCTCAGgtaaggaaaa ... atattcccagATTGGTGGTGAACTTATGGATTTTATAGTTGTTCTTCGTGATATGAAAGCT
EST: GGTCTGCACCGTCAGCAATATTCTCCCTGGGTTTAGGATGGGGTGCTCAG ATTGGTGGTGAACTTATGGATTTTATAGTTGTTCTTCGTGATATGAAAGCTEST: gi|254343584|gb|GR857340.1|GR857340
genomic: GGTCTGCACCGTCAGCAATATTCTCCCTGGGTTTAGGATGGGGTGCTCAGgtaaggaaaa ... atattcccagATTGGTGGTGAACTTATGGATTTTATAGTTGTTCTTCGTGATATGAAAGCT
EST: GATGGGGTGCTCAG ATTGGTGGTGAACTTATGGATTTTATAGTTGTTCTTCGTGATATGAAAGCTEST: gi|192319364|gb|FK009906.1|FK009906
genomic: GATGGGGTGCTCAGgtaaggaaaa ... atattcccagATTGGTGGTGAACTTATGGATTTTATAGTTGTTCTTCGTGATATGAAAGCT
EST: GGTCTGCACCGTCAGCAATATTCTCCCTGGGTTTAGGATGGGGTGCTCAG ATTGGTGGTGAACTTATGGATTTTATAGTTGTTCTTCGTGATATGAAAGCT
genomic: GGTCTGCACCGTCAGCAATATTCTCCCTGGGTTTAGGATGGGGTGCTCAGgtaaggaaaa ... atattcccagATTGGTGGTGAACTTATGGATTTTATAGTTGTTCTTCGTGATATGAAAGCT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TTACAAACTGGGTACTGGCTTGGTTGTTGCTCGAAGATCAGACGGATCATGGTCTGCACCGTCAGCAATATTCTCCCTGGGTTTAGGATGGGGTGCTCAGgtaaggaaaatatatactagtttagtttatctttagaattttgactatggttatgctcactgatatggtttgatagaaaaaatggagaaagaatatacca
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGGATG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - agaaaaaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gagaaaga