1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
TTGGCTATGCTGTACCGGGCTCGGTTCTACAACTTCTGCTTTCCAAATACGGTGATGGAAGTGGTAGGAGGGTTGAACTTGGTTTTGACAGTTTTGTCGAgtaagatttttttatctgggtctttgaagagagtaaattttcattttggtagttgagagattttttaatcattaatttggtcctcgaaatgttattacat...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA12G31070.1 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GGTGATGGAAGTGGTAGGAGGGTTGAACTTGGTTTTGACAGTTTTGTCGA GTGTGGGATGATTATTAAGEST: gi|37995098|gb|CF806687.1|CF806687
genomic: GGTGATGGAAGTGGTAGGAGGGTTGAACTTGGTTTTGACAGTTTTGTCGAgtaagatttt ... atgtatgcagGTGTGGGATGATTATTAAG
EST: GGTGATGGAAGTGGTAGGAGGGTTGAACTTGGTTTTGACAGTTTTGTCGA GAGTGGGATGATTATTAAGEST: gi|4299730|gb|AI442946.1|AI442946
genomic: GGTGATGGAAGTGGTAGGAGGGTTGAACTTGGTTTTGACAGTTTTGTCGAgtaagatttt ... atgtatgcagGTGTGGGATGATTATTAAG
EST: GGTGATGGAAGTGGTAGGAGGGTTGAACTTGGTTTTGACAGTTTTGTCGA GTGTGGGATGATTATTAAGEST: gi|192295230|gb|FG986949.1|FG986949
genomic: GGTGATGGAAGTGGTAGGAGGGTTGAACTTGGTTTTGACAGTTTTGTCGAgtaagatttt ... atgtatgcagGTGTGGGATGATTATTAAG
EST: GGTGATGGAAGTGGTAGGAGGGTTGAACTTGGTTTTGACAGTTTTGTCGA GTGTGGGATGATTATTAAGEST: gi|16342198|gb|BI967793.1|BI967793
genomic: GGTGATGGAAGTGGTAGGAGGGTTGAACTTGGTTTTGACAGTTTTGTCGAgtaagatttt ... atgtatgcagGTGTGGGATGATTATTAAG
EST: GGTGATGGAAGTGGTAGGAGGGTTGAACTTGGTTTTGACAGTTTTGTCGA GTGTGGGATGATTATTAAGEST: gi|9903330|gb|BE612298.1|BE612298
genomic: GGTGATGGAAGTGGTAGGAGGGTTGAACTTGGTTTTGACAGTTTTGTCGAgtaagatttt ... atgtatgcagGTGTGGGATGATTATTAAG
EST: GGTGATGGAAGTGGTAAGAGG-TTGAACTNGGTTT-GACAGTTT-GTCGA GTGTGGGATGATNATTAAG
genomic: GGTGATGGAAGTGGTAGGAGGGTTGAACTTGGTTTTGACAGTTTTGTCGAgtaagatttt ... atgtatgcagGTGTGGGATGATTATTAAG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TTGGCTATGCTGTACCGGGCTCGGTTCTACAACTTCTGCTTTCCAAATACGGTGATGGAAGTGGTAGGAGGGTTGAACTTGGTTTTGACAGTTTTGTCGAgtaagatttttttatctgggtctttgaagagagtaaattttcattttggtagttgagagattttttaatcattaatttggtcctcgaaatgttattacat
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GATGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAAG