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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CAGAGCACCCTGAAGAGAATAGGGGTGAATGCCATCCCGGCTATTGAGGAGGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcagtccacaatatttagaacatatatatttatattttttaatataatagactatatatttcttcaattatattaagttggaaaattttgtttccag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA11G12170.1
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA11G12170.1 (Glycine max), 5'ss of exon 3
lower sequence: LOC_Os03g01910.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 3
CAGAGCACCCTGAAGAGAATAGGGGTGAATGCCATCCCGGCTATTGAGGAGGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcagtccacaatatttagaacatatatatttatattttttaatataatagactatatatttcttcaattatattaagttggaaaattttgtttccag
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CAAAGCACCTTGAAAAGAGTAGGAGTGAACAACATTCCTGGTATCGAAGAGGTCAATATCTTCAAGGATGATGTGGTTATCCAATTTCAGAATCCAAAAGgtgaaat---tctaccatgctga-agcttctatag----aattgataactcgctcc-ctgttttcttctgaaattgtcttctattcttgccttcc---tgcag

upper sequence: GLYMA11G12170.1 (Glycine max), 5'ss of exon 3
lower sequence: GRMZM2G131577_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 2
CAGAGCACCCTGAAGAGAATAGGGGTGAATGCCATCCCGGCTATTGAGGAGGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatat----cagtccacaatatttag-aacatatatattta---tattttttaatataatagactatatatttcttcaattatattaagttggaaaattttgtttccag
|||||||||||||| |||||||| |||||  |||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| | ||||| |||||||| ||    ||| || || || | |  |  ||   || ||    |||||| ||| |  ||    | | |    |||||                               
CAGAGCACCCTGAAAAGAATAGGAGTGAACACCATTCCTGGTATTGAAGAGGTCAACATCTTTAAGGATGATGTTGTTATTCAGTTTGTGAATCCTAAAGgtaagatactccagaccccagtactcaacaggattagtacttgacttattttctaacaatattttttttgttccccttcag------------------------------

upper sequence: GLYMA11G12170.1 (Glycine max), 5'ss of exon 3
lower sequence: GRMZM2G001887_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 3
CAGAGCACCCTGAAGAGAATAGGGGTGAATGCCATCCCGGCTATTGAGGAGGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatat----cagtccacaatatttag-aacatatatatttatattttttaatataatagactatatattt--cttcaattatattaagttggaaaattttgtttccag
|| |||||| |||| |||||||| |||||   ||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||  ||      | |  || || | |  || ||   || ||   || |||   | ||||   | |   ||   || ||                               
CAAAGCACCTTGAAAAGAATAGGAGTGAACAGCATTCCTGGTATTGAAGAGGTCAACATCTTTAAGGATGATGTTGTTATTCAGTTTGTAAATCCTAAAGgtatgatactctggactccagtactcaacaagattagtacttcacttatttctaaaaatattttgtgggttcccctccag------------------------------

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|298181429|gb|HO022868.1|HO022868
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|298172348|gb|HO019388.1|HO019388
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCTACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|26047549|gb|CA784297.1|CA784297
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|15200916|gb|BI424597.1|BI424597
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTATTTCCCACAG                         CTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|4396833|gb|AI495830.1|AI495830
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|192315395|gb|FK007769.1|FK007769
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|298192041|gb|HO036123.1|HO036123
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGTTGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|4397094|gb|AI496091.1|AI496091
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|298169545|gb|HO020905.1|HO020905
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|20498345|gb|BQ273275.1|BQ273275
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
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EST: gi|209717197|gb|BW657662.1|BW657662
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|151410295|gb|EV280110.1|EV280110
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|7924357|gb|AW830383.1|AW830383
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|192312993|gb|FK003645.1|FK003645
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|298166875|gb|HO010314.1|HO010314
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|151399266|gb|EV269137.1|EV269137
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|298174000|gb|HO017336.1|HO017336
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCTAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|9203452|gb|BE329605.1|BE329605
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|33390729|gb|CA853924.1|CA853924
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|192333656|gb|FK025445.1|FK025445
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|22541348|gb|BU091191.1|BU091191
EST:     GGTCAATATCTNTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|7925525|gb|AW831551.1|AW831551
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|208303863|gb|GE105638.1|GE105638
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGCTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
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EST: gi|7925391|gb|AW831356.1|AW831356
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EST: gi|192322607|gb|FK014728.1|FK014728
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|207845205|gb|GD816230.1|GD816230
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|298198189|gb|HO039728.1|HO039728
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|192333328|gb|FK024305.1|FK024305
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|4314122|gb|AI461241.1|AI461241
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|192333464|gb|FK023993.1|FK023993
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|298188089|gb|HO032046.1|HO032046
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|298183450|gb|HO028663.1|HO028663
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|19934901|gb|BQ079931.1|BQ079931
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|19053051|gb|BM731718.1|BM731718
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|192333376|gb|FK024353.1|FK024353
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|208334826|gb|GE127031.1|GE127031
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|120495180|gb|EH223347.1|EH223347
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|213597706|gb|DB962160.1|DB962160
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|16996660|gb|BM086032.1|BM086032
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
genomic: GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcag ... ttgtttccagTTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
EST: gi|10232903|gb|BE801800.1|BE801800
EST:     GGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAG                         TTCAAGCATCCATTGCTGCTAATACTTGGGTTGTCAGTGGTTCTCCACAAA
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Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
CAGAGCACCCTGAAGAGAATAGGGGTGAATGCCATCCCGGCTATTGAGGAGGTCAATATCTTTAAGGATGACGTAGTTATCCAGTTTCTAAATCCCAAAGgtaatatcagtccacaatatttagaacatatatatttatattttttaatataatagactatatatttcttcaattatattaagttggaaaattttgtttccag

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGGATG