1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
GTTTGCATGTTGTGGTTACCATGTTTACTGGCTATCTTCTCGGATATGCAGCATTTAGAGCATTGTTTAATCACAGTCCTGCCATGgtactacctaaaatctgtttttcattgttattcatttatatcctcaaatagttgtagttatgagttttcatttctcttcgtttccttcctttcttgtctctatttccag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA10G35690.1 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TTCTCGGATATGCAGCATTTAGAGCATTGTTTAATCACAGTCCTGCCATG AATGCCGCTGGAGGAATTCTTGGGTTGGTTGGTGCCATGTTTGTTGAAACTEST: gi|23734175|gb|BU765314.1|BU765314
genomic: TTCTCGGATATGCAGCATTTAGAGCATTGTTTAATCACAGTCCTGCCATGgtactaccta ... ctatttccagAATGCCGCTGGAGGAATTCTTGGGTTGGTTGGTGCCATGTTTGTTGAAACT
EST: TTCTCGGATATGCAGCATTTAGAGCATTGTTTAATCACAGTCCTGCCATG AATGCCGCTGGAGGAATTCTTGGGTTEST: gi|22525449|gb|BU084260.1|BU084260
genomic: TTCTCGGATATGCAGCATTTAGAGCATTGTTTAATCACAGTCCTGCCATGgtactaccta ... ctatttccagAATGCCGCTGGAGGAATTCTTGGGTT
EST: TTCTCGGATATGCAGCATTTAGAGCATTGTTTAATCACAGTCCTGCCATG AATGCCGCTGGAGGAATTCTTGGGTTGGTTGGTGCCATGTEST: gi|23734386|gb|BU765421.1|BU765421
genomic: TTCTCGGATATGCAGCATTTAGAGCATTGTTTAATCACAGTCCTGCCATGgtactaccta ... ctatttccagAATGCCGCTGGAGGAATTCTTGGGTTGGTTGGTGCCATGT
EST: TTCTCGGATATGCAGCATTTAGAGCATTGTTTAATCACAGTCCTGCCATG AATGCCGCTGGAGGAATTCTTGGGTTGGTTGGTGCCATGTTTGTTGAAACT
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atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GTTTGCATGTTGTGGTTACCATGTTTACTGGCTATCTTCTCGGATATGCAGCATTTAGAGCATTGTTTAATCACAGTCCTGCCATGgtactacctaaaatctgtttttcattgttattcatttatatcctcaaatagttgtagttatgagttttcatttctcttcgtttccttcctttcttgtctctatttccag
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