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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GGCTGCGTTCTATTGGATTTAATGTTGTTGCATCTGTTATTATGGCTATTGTTATCAATGTTGGATTGAGTTACCCCACTCTACCTgtaagtcattcttgatttttccttttttcctttaatagttagaaccaaaagggacataaaagggacaattatatatactgaatgttgtaatatacttatg...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA10G33350.1
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|298195729|gb|HO044120.1|HO044120
EST:     TTATTATGGCTATTGTTATCAATGTTGGATTGAGTTACCCCACTCTACCT                         AATTGGTTCCCTTCTCTCCTTTTTCCTATCTACATACACAACATACACAAA
genomic: TTATTATGGCTATTGTTATCAATGTTGGATTGAGTTACCCCACTCTACCTgtaagtcatt ... aattatacagAATTGGTTCCCTTCTCTCCTTTTTCCTATCTACATACACAACATACACAAA
EST: gi|298185669|gb|HO030882.1|HO030882
EST:     TTATTATGGCTATTGTTATCAATGTTGGATTGAGTTACCCCACTCTACCT                         AATTGGTTCCCTTCTCTCCTTTTTCCTATCTACATACACAACATACACAAA
genomic: TTATTATGGCTATTGTTATCAATGTTGGATTGAGTTACCCCACTCTACCTgtaagtcatt ... aattatacagAATTGGTTCCCTTCTCTCCTTTTTCCTATCTACATACACAACATACACAAA
EST: gi|213591840|gb|DB973405.1|DB973405
EST:     TTATTATGGCTATTGTTATCAATGTTGGATTGAGTTACCCCACTCTACCT                         AATTGGTTCCCTTCTCTCCTTTTTCCTATCTACATACACAACATACACAAA
genomic: TTATTATGGCTATTGTTATCAATGTTGGATTGAGTTACCCCACTCTACCTgtaagtcatt ... aattatacagAATTGGTTCCCTTCTCTCCTTTTTCCTATCTACATACACAACATACACAAA
EST: gi|298192764|gb|HO033198.1|HO033198
EST:     TTATTATGGCTATTGTTATCAATGTTGGATTGAGTCACCCCACTCTACCT                         AATTGGTTCCCTTCTCTCCTTTTTCCTATCTACATACACAACATACACAAA
genomic: TTATTATGGCTATTGTTATCAATGTTGGATTGAGTTACCCCACTCTACCTgtaagtcatt ... aattatacagAATTGGTTCCCTTCTCTCCTTTTTCCTATCTACATACACAACATACACAAA
EST: gi|298184162|gb|HO029375.1|HO029375
EST:     TTATTATGGCTATTGTTATCAATGTTGGATTGAGTTACCCCACTCTACCT                         AATTGGTTCCCTTCTCTCCTTTTTCCTATCTACATACACAACATACACAAA
genomic: TTATTATGGCTATTGTTATCAATGTTGGATTGAGTTACCCCACTCTACCTgtaagtcatt ... aattatacagAATTGGTTCCCTTCTCTCCTTTTTCCTATCTACATACACAACATACACAAA
EST: gi|298179629|gb|HO024844.1|HO024844
EST:     TTATTATGGCTATTGTTATCAATGTTGGATTGAGTTACCCCACTCTACCT                         AATTGGTTCCCTTCTCTCCTTTTTCCTATCTACATACACAACATACACAAA
genomic: TTATTATGGCTATTGTTATCAATGTTGGATTGAGTTACCCCACTCTACCTgtaagtcatt ... aattatacagAATTGGTTCCCTTCTCTCCTTTTTCCTATCTACATACACAACATACACAAA
EST: gi|298164832|gb|HO010829.1|HO010829
EST:     TTATTATGGCTATTGTTATCAATGTTGGATTGAGTTACCCCACTCTACCT                         AATTGGTTCCCTTCTCTCCTTTTTCCTATCTACATACACAACGTACACAAA
genomic: TTATTATGGCTATTGTTATCAATGTTGGATTGAGTTACCCCACTCTACCTgtaagtcatt ... aattatacagAATTGGTTCCCTTCTCTCCTTTTTCCTATCTACATACACAACATACACAAA
EST: gi|298182340|gb|HO026515.1|HO026515
EST:     TTATTATGGCTATTGTTATCAATGTTGGATTGAGTTACCCCACTCTACCT                         AATTGGTTCCCTTCTCTCCTTTTTCCTATCTACATACACAACATACACAAA
genomic: TTATTATGGCTATTGTTATCAATGTTGGATTGAGTTACCCCACTCTACCTgtaagtcatt ... aattatacagAATTGGTTCCCTTCTCTCCTTTTTCCTATCTACATACACAACATACACAAA