1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
ACTGATGGGCAAGAATTCTTCACCTCTTATGATGAAGTGTATGACAGCTTTGATGCAATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactggcatattgtgatccccttattttaaatgtttattcatatctgttacagtgccgattgctctgagagactttaaaattcagttaaaaatat...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA08G20300.3 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TGATGCAATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATG GTTTTGAGAGGCCTTCTGCTATACAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCAEST: gi|192296157|gb|FG989742.1|FG989742
genomic: TGATGCAATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactg ... tgtttttaagGTTTTGAGAGGCCTTCTGCTATACAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
EST: TGATGCAATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATG GTTTTGAGAGGCCTTCTGCTATACAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCAEST: gi|6719017|gb|AW306664.1|AW306664
genomic: TGATGCAATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactg ... tgtttttaagGTTTTGAGAGGCCTTCTGCTATACAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
EST: TGATGCAATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATG GTTTTGAGAGGCCTTCTGCTATACAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCAEST: gi|9820437|gb|BE555947.1|BE555947
genomic: TGATGCAATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactg ... tgtttttaagGTTTTGAGAGGCCTTCTGCTATACAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
EST: TGATGCAATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATG GTTTTGAGAGGCCTTCTGCTATACAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCAEST: gi|6134879|gb|AW133272.1|AW133272
genomic: TGATGCAATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactg ... tgtttttaagGTTTTGAGAGGCCTTCTGCTATACAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
EST: TGATGCAATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATG GTTTTGAGAGGCCTTCTGCTATACAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCAEST: gi|193571344|gb|FK528193.1|FK528193
genomic: TGATGCAATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactg ... tgtttttaagGTTTTGAGAGGCCTTCTGCTATACAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
EST: ATATATGCTTATG GTTTTGAGAGGCCTTCTGCTATACAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCAEST: gi|16347160|gb|BI972755.1|BI972755
genomic: ATATATGCTTATGgtatgtactg ... tgtttttaagGTTTTGAGAGGCCTTCTGCTATACAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
EST: TGATGCAATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATG GTTTTGAGAGGCCTTCTGCTATACAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCAEST: gi|7286082|gb|AW598569.1|AW598569
genomic: TGATGCAATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactg ... tgtttttaagGTTTTGAGAGGCCTTCTGCTATACAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
EST: TGATGCAATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATG GTTTTGAGAGGCCTTCTGCTATACAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCAEST: gi|21995036|gb|BQ786564.1|BQ786564
genomic: TGATGCAATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactg ... tgtttttaagGTTTTGAGAGGCCTTCTGCTATACAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
EST: TGATGCAATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATG GTTTTGAGAGGCCTTCTGCTATACAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCAEST: gi|37994639|gb|CF806304.1|CF806304
genomic: TGATGCAATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactg ... tgtttttaagGTTTTGAGAGGCCTTCTGCTATACAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
EST: TGATGCAATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATG GTTTTGAGAGGCCTTCTGCTATACAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCAEST: gi|9986909|gb|BE661017.1|BE661017
genomic: TGATGCAATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactg ... tgtttttaagGTTTTGAGAGGCCTTCTGCTATACAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
EST: TGATGCAATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATG GTTTTGAGAGGCCTTCTGCTATACAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCAEST: gi|6502132|gb|AW203505.1|AW203505
genomic: TGATGCAATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactg ... tgtttttaagGTTTTGAGAGGCCTTCTGCTATACAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
EST: TGATGCAATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATG GTTTTGAGAGGCCTTCTGCTATACAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
genomic: TGATGCAATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactg ... tgtttttaagGTTTTGAGAGGCCTTCTGCTATACAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ACTGATGGGCAAGAATTCTTCACCTCTTATGATGAAGTGTATGACAGCTTTGATGCAATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactggcatattgtgatccccttattttaaatgtttattcatatctgttacagtgccgattgctctgagagactttaaaattcagttaaaaatat
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tcccctt