Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

AGGTGGATATTCCACCAACTCAGCTTGTAGGTGGAATGATTCCACCTCCTTTGGGTACAGGATATCCTCCGCGACCAACCTTGCCCACAATGCCACCAATgtatgttattatttctatgtttctatttgtatacatcttctatttggcataagtaggaagttgtaattcttacgtattatacttatttaaaattatgtgaatggcacaaatatgctcacgtgcttacctctctgctttag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA08G05390.2
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|208267696|gb|GE066801.1|GE066801
EST:     TTGGGTACAGGATATCCTCCGCGACCAACCTTGCCCACAATGCCACCAAT                         GTATAATCCTGCTGTACCTGTGCCTCCAAATGCTTGGATGGTT
genomic: TTGGGTACAGGATATCCTCCGCGACCAACCTTGCCCACAATGCCACCAATgtatgttatt ... tctgctttagGTATAATCCTGCTGTACCTGTGCCTCCAAATGCTTGGATGGTT
EST: gi|15813116|gb|BI785391.1|BI785391
EST:     TTGGGTACAGGATATCCTCCGCGACCAACCTTGCCCACAATGCCACCAAT                         GTATAATCCTGCTGTACCTGTGCCTCCAAATGCTTGGATGGTTCCACCTCG
genomic: TTGGGTACAGGATATCCTCCGCGACCAACCTTGCCCACAATGCCACCAATgtatgttatt ... tctgctttagGTATAATCCTGCTGTACCTGTGCCTCCAAATGCTTGGATGGTTCCACCTCG
EST: gi|8285685|gb|BE023244.1|BE023244
EST:     AGGATATCCTCCGCGACCAACCTTGCCCACAATGCCACCAAT                         GTATAATCCTGCTGTACCTGTGCCTCCAAATGCTTGGATGGTTCCACCTCG
genomic: AGGATATCCTCCGCGACCAACCTTGCCCACAATGCCACCAATgtatgttatt ... tctgctttagGTATAATCCTGCTGTACCTGTGCCTCCAAATGCTTGGATGGTTCCACCTCG
EST: gi|16996888|gb|BM086260.1|BM086260
EST:     TTGGGTACAGGATATCCTCCGCGACCAACCTTGCCCACAATGCCACCAAT                         GTATAATCCTGCTGTACCTGTGCCTCCAAATGCTTGGATGGTTCCACCTCG
genomic: TTGGGTACAGGATATCCTCCGCGACCAACCTTGCCCACAATGCCACCAATgtatgttatt ... tctgctttagGTATAATCCTGCTGTACCTGTGCCTCCAAATGCTTGGATGGTTCCACCTCG
EST: gi|193476843|gb|FK439046.1|FK439046
EST:     TTGGGTACAGGATATCCTCCGCGACCAACCTTGCCCACAATGCCACCAAT                         GTATAATCCTGCTGTACCTGTGCCTCCAAATGCTTGGATGGTTCCACCTCG
genomic: TTGGGTACAGGATATCCTCCGCGACCAACCTTGCCCACAATGCCACCAATgtatgttatt ... tctgctttagGTATAATCCTGCTGTACCTGTGCCTCCAAATGCTTGGATGGTTCCACCTCG
EST: gi|5342770|gb|AI795054.1|AI795054
EST:     TTGGGTACAGGATATCCTCCGCGACCAACCTTGCCCACAATGCCACCAAT                         GTATAATCCTGCTGTACCTGTGCCTCCAAATGCTTGGATGGTTCCACCTCG
genomic: TTGGGTACAGGATATCCTCCGCGACCAACCTTGCCCACAATGCCACCAATgtatgttatt ... tctgctttagGTATAATCCTGCTGTACCTGTGCCTCCAAATGCTTGGATGGTTCCACCTCG
EST: gi|6913444|gb|AW394974.1|AW394974
EST:     TTGGGTACAGGATATCCTCCGCGACCAACCTTGCCCACAATGCCACCAAT                         GTATAATCCTGCTGTACCTGTGCCTCCAAATGCTTGGATGGTTCCACCTCG
genomic: TTGGGTACAGGATATCCTCCGCGACCAACCTTGCCCACAATGCCACCAATgtatgttatt ... tctgctttagGTATAATCCTGCTGTACCTGTGCCTCCAAATGCTTGGATGGTTCCACCTCG
EST: gi|254345519|gb|GR851681.1|GR851681
EST:     TTGGGTACAGGATATCCTCCGCGACCAACCTTGCCCACAATGCCACCAAT                         GTATAATCCTGCTGTACCTGTGCCTCCAAATGCTTGGATGGTTCCACCTCG
genomic: TTGGGTACAGGATATCCTCCGCGACCAACCTTGCCCACAATGCCACCAATgtatgttatt ... tctgctttagGTATAATCCTGCTGTACCTGTGCCTCCAAATGCTTGGATGGTTCCACCTCG