1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
CCACTTGGCTACCATTCCCATCACAGGAACTGGCATTAACCCAGCTAGGAGTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgtttttttgagacttgaatttttgtttcatatattcccattagcataggaaataatgtaaatagttttattgaattttattataattatcttaccg...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA08G01860.1 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGEST: gi|8825821|gb|BE209551.1|BE209551
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGG
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGTCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|209713451|gb|BW679253.1|BW679253
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|193435590|gb|FK401966.1|FK401966
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: TCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCAATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|208036320|gb|GD835565.1|GD835565
genomic: TCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACC-ATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|208207956|gb|GE002949.1|GE002949
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|31473970|gb|CD415998.1|CD415998
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCAATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAEST: gi|31473068|gb|CD415096.1|CD415096
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCA-TTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTA
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|192297999|gb|FG988413.1|FG988413
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGTCATCATCTACA-CAGAGAC-ATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGT-GGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|6964336|gb|AW433029.1|AW433029
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|208185795|gb|GD983820.1|GD983820
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|10232248|gb|BE801136.1|BE801136
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|31457966|gb|CD399994.1|CD399994
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATTATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|193304092|gb|FK271185.1|FK271185
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGAEST: gi|193339892|gb|FK306583.1|FK306583
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGA
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|214008371|gb|DB986313.1|DB986313
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|208281596|gb|GE078532.1|GE078532
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|31465520|gb|CD407548.1|CD407548
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATTATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|208049824|gb|GD849707.1|GD849707
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|31463980|gb|CD406008.1|CD406008
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGATTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|193379777|gb|FK345335.1|FK345335
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: TCTCGGAGCTGCCAATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|31466573|gb|CD408601.1|CD408601
genomic: TCTCGGAGCTGCCA-TCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|31311203|gb|CD396406.1|CD396406
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATAATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|193307898|gb|FK271542.1|FK271542
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|193385277|gb|FK352739.1|FK352739
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAEST: gi|193553366|gb|FK509989.1|FK509989
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTT-CTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTA
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|31305582|gb|CD390785.1|CD390785
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|193346607|gb|FK311779.1|FK311779
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: ACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|22522357|gb|BU081168.1|BU081168
genomic: ACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|193690171|gb|FK627986.1|FK627986
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|193647547|gb|FK587986.1|FK587986
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|208288505|gb|GE088774.1|GE088774
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|31464161|gb|CD406189.1|CD406189
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|31560937|gb|CD486775.1|CD486775
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|6726487|gb|AW310841.1|AW310841
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTTGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGATGTGTATEST: gi|16346247|gb|BI971842.1|BI971842
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|208291147|gb|GE085535.1|GE085535
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|6725948|gb|AW310347.1|AW310347
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|6095240|gb|AW119907.1|AW119907
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGT-GGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|151401852|gb|EV271665.1|EV271665
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: CTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|193694425|gb|FK629569.1|FK629569
genomic: CTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|193619596|gb|FK572612.1|FK572612
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|31473817|gb|CD415845.1|CD415845
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|193599617|gb|FK552518.1|FK552518
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|192330400|gb|FK022615.1|FK022615
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTTTCGGAGCTGCCATCATTTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTTTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGCGTATEST: gi|208122527|gb|GD925375.1|GD925375
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|193479368|gb|FK445049.1|FK445049
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|193351184|gb|FK316746.1|FK316746
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTTCTGGGTTGGACCTTTEST: gi|31463750|gb|CD405778.1|CD405778
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTT-CTGGGTTGGACCTTT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATTATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|31461519|gb|CD403547.1|CD403547
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|193405313|gb|FK372634.1|FK372634
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|7590667|gb|AW706477.1|AW706477
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|193322086|gb|FK287006.1|FK287006
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|31458370|gb|CD400398.1|CD400398
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|193415677|gb|FK380623.1|FK380623
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|10710525|gb|BF010243.1|BF010243
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|193639467|gb|FK585708.1|FK585708
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|208152245|gb|GD947446.1|GD947446
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|5175514|gb|AI759847.1|AI759847
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|19938517|gb|BQ081757.1|BQ081757
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|7233370|gb|AW568717.1|AW568717
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|31472445|gb|CD414473.1|CD414473
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATTATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|193360364|gb|FK325134.1|FK325134
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|207846232|gb|GD818027.1|GD818027
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGATCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|31468209|gb|CD410237.1|CD410237
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|31307468|gb|CD392671.1|CD392671
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|192298833|gb|FG988654.1|FG988654
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACA-CAGAGAC-ATGTATGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTEST: gi|208024833|gb|GD826507.1|GD826507
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGT
EST: TGGGATGACCAA TGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTATEST: gi|6095052|gb|AW119719.1|AW119719
genomic: TGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGGATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTAT
EST: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAA TGGGATTT-CTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTA
genomic: GTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgttttt ... tggtttacagTGG-ATTTTCTGGGTTGGACCTTTCATTGGAGCTGCCCTTGCTGCTGTGTA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CCACTTGGCTACCATTCCCATCACAGGAACTGGCATTAACCCAGCTAGGAGTCTCGGAGCTGCCATCATCTACAACAGAGACCATGCATGGGATGACCAAgtatgtttttttgagacttgaatttttgtttcatatattcccattagcataggaaataatgtaaatagttttattgaattttattataattatcttaccg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ggaaataa