1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
TGTTAATGTTGTCGCAACTTGTGTCTCAATTTATGGTGTTGACAAGTGGGGTAGGAGAGCCCTTTTCCTTGAAGGTGGAGTCCAAATGCTCATTTGCCAGgtacccttttgcttaatcttcaatgtactacttaattgtacaagttattgaatgaaaaaatgttgacttatgaaatggttatgattaaattaagtatatgttggtgtgtattgtatag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA07G30880.1 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GTAGGAGAGCCCTTTTCCTTGAAGGTGGAGTCCAAATGCTCATTTGCCAG GCTGTAGTTGCAGCTGCAATTGGAGCAAAGTTTGGAACTGATGGGAACCCAEST: gi|51344369|gb|CO985102.1|CO985102
genomic: GTAGGAGAGCCCTTTTCCTTGAAGGTGGAGTCCAAATGCTCATTTGCCAGgtaccctttt ... tattgtatagGCTGTAGTTGCAGCTGCAATTGGAGCAAAGTTTGGAACTGATGGGAACCCA
EST: GTAGGAGAGCCCTTTTCCTTGAAGGTGGAGTCCAAATGCTCATTTGCCAG GCTGTAGTTGCAGCTGCAATTGGAGCAAAGTTTGGAACTGATGGGAACCCAEST: gi|207831509|gb|GD801689.1|GD801689
genomic: GTAGGAGAGCCCTTTTCCTTGAAGGTGGAGTCCAAATGCTCATTTGCCAGgtaccctttt ... tattgtatagGCTGTAGTTGCAGCTGCAATTGGAGCAAAGTTTGGAACTGATGGGAACCCA
EST: GTAGGAGAGCCCTTTTCCTTGAAGGTGGAGTCCAAATGCTCATTTGCCAG GCTGTAGTTGCAGCTGCAATTGGAGCAAAGTTTGGAACTGATGGGAACCCAEST: gi|8284253|gb|BE021812.1|BE021812
genomic: GTAGGAGAGCCCTTTTCCTTGAAGGTGGAGTCCAAATGCTCATTTGCCAGgtaccctttt ... tattgtatagGCTGTAGTTGCAGCTGCAATTGGAGCAAAGTTTGGAACTGATGGGAACCCA
EST: GTAGGAGAGCCCTTTTCCTTGAAGGTGGAGTCCAAATGCTCATTTGCCAG GCTGTAGTTGCAGCTGCAATTGGAGCAAAGTGTGGA-CTGATGGGAACCCEST: gi|37995878|gb|CF807467.1|CF807467
genomic: GTAGGAGAGCCCTTTTCCTTGAAGGTGGAGTCCAAATGCTCATTTGCCAGgtaccctttt ... tattgtatagGCTGTAGTTGCAGCTGCAATTGGAGCAAAGTTTGGAACTGATGGGAACCC
EST: TGAAGGTGGAGTCCAAATGCTCATTTGCCAG GCTGTAGTTGCAGCTGCAATTGGAGCAAAGTTTGGAACTGATGGGAACCCAEST: gi|193331877|gb|FK299385.1|FK299385
genomic: TGAAGGTGGAGTCCAAATGCTCATTTGCCAGgtaccctttt ... tattgtatagGCTGTAGTTGCAGCTGCAATTGGAGCAAAGTTTGGAACTGATGGGAACCCA
EST: GTAGGAGAGCCCTTTTCCTTGAAGGTGGAGTCCAAATGCTCATTTGCCAG GCTGTAGTTGCAGCTGCAATTGGAGCAAAGTTTGGAACTGATGGGAACCCA
genomic: GTAGGAGAGCCCTTTTCCTTGAAGGTGGAGTCCAAATGCTCATTTGCCAGgtaccctttt ... tattgtatagGCTGTAGTTGCAGCTGCAATTGGAGCAAAGTTTGGAACTGATGGGAACCCA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TGTTAATGTTGTCGCAACTTGTGTCTCAATTTATGGTGTTGACAAGTGGGGTAGGAGAGCCCTTTTCCTTGAAGGTGGAGTCCAAATGCTCATTTGCCAGgtacccttttgcttaatcttcaatgtactacttaattgtacaagttattgaatgaaaaaatgttgacttatgaaatggttatgattaaattaagtatatgttggtgtgtattgtatag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGGAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGTGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GTGGAG