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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GAGAAGGAATTGATTCGGTTGAAACGCGAGGCCAAGCTGAAAGGTGGTTTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgtttctacttagactgagattttagaatattcatgttggtctaactatgtaatttgggtttttttcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA07G02270.1
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA07G02270.1 (Glycine max), 5'ss of exon 3
lower sequence: AT2G01250.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 3
GAGAAGGAATTGATTCGGTTGAAACGCGAGGCCAAGCTGAAAGGTGGTTTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgt------gtttctacttagactg--agattttagaatattcatgttggtctaactatg-taatttgg-gtttttttcag--------
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GAGAAGGAGTTGATCTCGTTGAAACGCGAGGCCAAGCTTAAGGGAGGTTTCTATGTTGACCCTGAAGCTAAGCTCTTGTTCATCATCCGTATCCGTGGgtatgttatactgttgttgtttgtcttataagcatttctaaagccagtgtctatgttgttgttcttatctgttgttctttttaatattgcag

upper sequence: GLYMA07G02270.1 (Glycine max), 5'ss of exon 3
lower sequence: AT2G44120.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 3
GAGAAGGAATTGATTCGGTTGAAACGCGAGGCCAAGCTGAAAGGTGGTTTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgtttctacttagactg------agattttagaatattcatgttggtct--aactatgtaatt-tgggtttttttcag
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GATAACGAGTTGATCCGATTGAAGCGGGAGGCTAAGTTGAAAGGAGGTTTCTACGTTGACCCTGAGGCTAAGTTGCTCTTTATCATTCGTATCCGTGGgtatgtgcctattatttgtgtgttacataagttgttgcatatagattctgttttttatttacgtgattgtttgtcatttgcag

upper sequence: GLYMA07G02270.1 (Glycine max), 5'ss of exon 3
lower sequence: PP1S2_667V6.2 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 1
--GAGAAGGAATTGATTCGGTTGAAACGCGAGGCCAAGCTGAAAGGTGGTTTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgt----gtttctacttagactgagattttagaatattcatgttggtctaactatgtaatttgggtttttttcag------------------------
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AGGAGTCTGATCTGATCCGACTGAAGAGAGAAGCGAAGCTGAAGGGTGGATTCTATGTGGAGCCTGAGGCCAAGCTCATGTTTGTTATTCGTATTCGTGGgtaagcaggagattctcttcgttctatggtgtgtgattaa--aggttgtggcgcctattctcggtgccttttctttaacttatcacattatggagttcaggt

upper sequence: GLYMA07G02270.1 (Glycine max), 5'ss of exon 3
lower sequence: PP1S2_667V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 2
GAGAAGGAATTGATTCGGTTGAAACGCGAGGCCAAGCTGAAAGGTGGTTTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgt----gtttctacttagactgagattttagaatattcatgttggtctaactatgtaatttgggtttttttcag------------------------
|||   ||  |||| ||  ||||  | || || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||  ||||| ||||||| ||||||||||| |     | ||||  |    ||  | | |  || ||   | ||||      ||||      ||  |||| || |                         
GAGTCTGATCTGATCCGACTGAAGAGAGAAGCGAAGCTGAAGGGTGGATTCTATGTGGAGCCTGAGGCCAAGCTCATGTTTGTTATTCGTATTCGTGGgtaagcaggagattctcttcgttctatggtgtgtgattaa--aggttgtggcgcctattctcggtgccttttctttaacttatcacattatggagttcaggt

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|298191175|gb|HO038654.1|HO038654
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTCATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|298183073|gb|HO028336.1|HO028336
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|7925315|gb|AW831402.1|AW831402
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|193536716|gb|FK490040.1|FK490040
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|213595918|gb|DB955982.1|DB955982
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|298191806|gb|HO035888.1|HO035888
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|213594462|gb|DB970028.1|DB970028
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|209704639|gb|BW656645.1|BW656645
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|12687947|gb|BG154222.1|BG154222
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|151410201|gb|EV280016.1|EV280016
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|58019438|gb|CX706180.1|CX706180
EST:     GGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: GGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|9204281|gb|BE330505.1|BE330505
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|7924220|gb|AW830246.1|AW830246
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|207735275|gb|GD711126.1|GD711126
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|207735275|gb|GD711126.1|GD711126
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|13481356|gb|BG510699.1|BG510699
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|192302088|gb|FG995222.1|FG995222
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|209722062|gb|BW659304.1|BW659304
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|213588560|gb|DB957624.1|DB957624
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|213617535|gb|DB969247.1|DB969247
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|151394375|gb|EV264246.1|EV264246
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|298185258|gb|HO030471.1|HO030471
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|5057333|gb|AI735809.1|AI735809
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|208270715|gb|GE070521.1|GE070521
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|15814466|gb|BI786741.1|BI786741
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|15286026|gb|BI469917.1|BI469917
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|254326340|gb|GR840932.1|GR840932
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|298195571|gb|HO043962.1|HO043962
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAGGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|192330146|gb|FK019786.1|FK019786
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|192317146|gb|FK009761.1|FK009761
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|7684798|gb|AW755446.1|AW755446
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|298173986|gb|HO017322.1|HO017322
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|151410828|gb|EV280643.1|EV280643
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|213616677|gb|DB969187.1|DB969187
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|13181260|gb|BG352600.1|BG352600
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGGACCCCAAATCAAGGAAGAT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGG-ACCCCAAATCAAGGAAGAT
EST: gi|192317131|gb|FK009760.1|FK009760
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|22540336|gb|BU090179.1|BU090179
EST:     TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
EST: gi|193673040|gb|FK620358.1|FK620358
EST:     TTCGCATTCGTGG                         TATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
genomic: TTCGCATTCGTGGgtatgtgttt ... tttttttcagTATTAATGCCATGGACCCCAAATCAAGGAAGATCCTGCAGTTGTTGCGATT
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Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
GAGAAGGAATTGATTCGGTTGAAACGCGAGGCCAAGCTGAAAGGTGGTTTCTATGTGGATCCAGAGGCTAAGCTGTTGTTTATTATTCGCATTCGTGGgtatgtgtttctacttagactgagattttagaatattcatgttggtctaactatgtaatttgggtttttttcag

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