1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
ACTGATGGGCAAGAATTCTTCACCTCATATGACGAAGTCTATGACAGCTTTGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactggcatattgatccccatattttaaatgcttatacatatctgttgcagtgtcaattgctctgcgagactttaaaattcagttaaaagtataa...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA07G00950.1 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATG GTTTTGAGAGGCCTTCTGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCAEST: gi|213600324|gb|DB964362.1|DB964362
genomic: TGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactg ... tgttcttaagGTTTTGAGAGGCCTTCTGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
EST: TGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATG GTTTTGAGAGGCCTTCTGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCAEST: gi|7478717|gb|AW666377.1|AW666377
genomic: TGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactg ... tgttcttaagGTTTTGAGAGGCCTTCTGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
EST: TGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATG GTTTTGAGAGGCCTTCTGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCAEST: gi|18690820|gb|BM519668.1|BM519668
genomic: TGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactg ... tgttcttaagGTTTTGAGAGGCCTTCTGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
EST: TGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATG GTTTTGAGAGGCCTTCTGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCAEST: gi|298189308|gb|HO037711.1|HO037711
genomic: TGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactg ... tgttcttaagGTTTTGAGAGGCCTTCTGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
EST: TGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATG GTTTTGAGAGGCCTTCTGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCAEST: gi|298187389|gb|HO034538.1|HO034538
genomic: TGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactg ... tgttcttaagGTTTTGAGAGGCCTTCTGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
EST: TGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATG GTTTTGAGAGGCCTTCTGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCAEST: gi|298174095|gb|HO017431.1|HO017431
genomic: TGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactg ... tgttcttaagGTTTTGAGAGGCCTTCTGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
EST: TGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATG GTTTTGAGAGGCCTTCTGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCAEST: gi|209707371|gb|BW670637.1|BW670637
genomic: TGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactg ... tgttcttaagGTTTTGAGAGGCCTTCTGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
EST: TGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATG GTTTTGAGAGGCCTTCTGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCAEST: gi|209720997|gb|BW682476.1|BW682476
genomic: TGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactg ... tgttcttaagGTTTTGAGAGGCCTTCTGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
EST: TGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATG GTTTTGAGAGGCCTTCTGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCAEST: gi|15337080|gb|BI497736.1|BI497736
genomic: TGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactg ... tgttcttaagGTTTTGAGAGGCCTTCTGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
EST: TGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATG GTTTTGAGAGGCCTTCTGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCAEST: gi|298177476|gb|HO023609.1|HO023609
genomic: TGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactg ... tgttcttaagGTTTTGAGAGGCCTTCTGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
EST: TGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATG GTTTTGAGAGGCCTTCTGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCAEST: gi|298184844|gb|HO030057.1|HO030057
genomic: TGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactg ... tgttcttaagGTTTTGAGAGGCCTTCTGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
EST: TGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATG GTTTTGAGAGGCCTTCTGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCAEST: gi|298193029|gb|HO033407.1|HO033407
genomic: TGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactg ... tgttcttaagGTTTTGAGAGGCCTTCTGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
EST: TGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATG GTTTTGAGAGGCCTTCTGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
genomic: TGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactg ... tgttcttaagGTTTTGAGAGGCCTTCTGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTTCCTTTCTGCA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ACTGATGGGCAAGAATTCTTCACCTCATATGACGAAGTCTATGACAGCTTTGATGCCATGGGATTGCAAGAGAATCTTCTGCGAGGCATATATGCTTATGgtatgtactggcatattgatccccatattttaaatgcttatacatatctgttgcagtgtcaattgctctgcgagactttaaaattcagttaaaagtataa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAGA