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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GAAGGAAAACCTCTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacctcactataaatatactttctttcttctcatttccggtgacattatgctctgaactttttatgatgttctgttctgcattattttcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA06G08670.1
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|213618075|gb|DB963708.1|DB963708
EST:     CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGT                         GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
genomic: CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
EST: gi|5606173|gb|AI900271.1|AI900271
EST:     CATAAATGACGT                         GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
genomic: CATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
EST: gi|27808994|gb|CB063416.1|CB063416
EST:     CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGT                         GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
genomic: CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
EST: gi|17022063|gb|BM093097.1|BM093097
EST:     GCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGT                         GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
genomic: GCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
EST: gi|37997401|gb|CF808990.1|CF808990
EST:     CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGT                         GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
genomic: CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
EST: gi|151408997|gb|EV278805.1|EV278805
EST:     CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGT                         GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
genomic: CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
EST: gi|213587077|gb|DB961772.1|DB961772
EST:     CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGT                         GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
genomic: CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
EST: gi|151394218|gb|EV264089.1|EV264089
EST:     CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGT                         GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
genomic: CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
EST: gi|6454608|gb|AW185291.1|AW185291
EST:     CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGT                         GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
genomic: CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
EST: gi|9986765|gb|BE660873.1|BE660873
EST:     CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGT                         GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
genomic: CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
EST: gi|151395018|gb|EV264889.1|EV264889
EST:     CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGT                         GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
genomic: CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
EST: gi|298184704|gb|HO029917.1|HO029917
EST:     CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGT                         GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
genomic: CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
EST: gi|213588877|gb|DB967957.1|DB967957
EST:     CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGT                         GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
genomic: CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
EST: gi|16996361|gb|BM085733.1|BM085733
EST:     CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGT                         GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
genomic: CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
EST: gi|192307206|gb|FK001220.1|FK001220
EST:     CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGT                         GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
genomic: CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
EST: gi|24135997|gb|BU926507.1|BU926507
EST:     GAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGT                         GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
genomic: GAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
EST: gi|298196933|gb|HO041676.1|HO041676
EST:     CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGT                         GTCACGCGACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
genomic: CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
EST: gi|209723439|gb|BW682393.1|BW682393
EST:     CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGT                         GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
genomic: CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
EST: gi|24205360|gb|BU964613.1|BU964613
EST:     CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGT                         GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
genomic: CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
EST: gi|298196196|gb|HO044587.1|HO044587
EST:     CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGT                         GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
genomic: CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
EST: gi|7925748|gb|AW831774.1|AW831774
EST:     CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGT                         GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTNTAATAA
genomic: CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
EST: gi|209696907|gb|BW660472.1|BW660472
EST:     CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGT                         GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
genomic: CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
EST: gi|298174108|gb|HO017444.1|HO017444
EST:     CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGT                         GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
genomic: CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
EST: gi|209719273|gb|BW679815.1|BW679815
EST:     CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGT                         GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
genomic: CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
EST: gi|151411675|gb|EV281486.1|EV281486
EST:     CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGT                         GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAAGAA
genomic: CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
EST: gi|209714938|gb|BW650784.1|BW650784
EST:     CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGT                         GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
genomic: CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
EST: gi|18690845|gb|BM519693.1|BM519693
EST:     CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGT                         GTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA
genomic: CTTGTTTTGAATGTAGTGAGGCGAGTTGAACAGCAACTCATAAATGACGTgttagtacct ... ttattttcagGTCACGCAACAAGGAATATATTCCGATCGTTGGGCTTGCTGATTTTAATAA