Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GCTTCCAGTTGGATCTCGAGTTGTTGGGGCCTTCATCATGCCTTGTGGCAACTGCTCCTACTGTTCAAAGgtaatactgtgttaaacacttcactctgtatgttaactggattcttgttcattgttgatgttgtctccaaatggtatacag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA05G33140.1
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|5753618|gb|AI960905.1|AI960905
EST:     TTGTTGGGGCCTTCATCATGCCTTGTGGCAACTGCTCCTACTGTTCAAAG                         GGCCATGATGATCTATGTGAAGCTTTCTTTGCCTATAACCGGGCAAAAGGA
genomic: TTGTTGGGGCCTTCATCATGCCTTGTGGCAACTGCTCCTACTGTTCAAAGgtaatactgt ... tggtatacagGGCCATGATGATCTATGTGAAGCTTTCTTTGCCTATAACCGGGCAAAAGGA
EST: gi|14258428|gb|BG881336.1|BG881336
EST:     TTGTTGGGGCCTTCATCATGCCTTGTGGCAACTGCTCCTACTGTTCAAAG                         GGCCATGATGATCTATGTGAAGCTTTCTTTGCCTATAACCGGGCAAAAGGA
genomic: TTGTTGGGGCCTTCATCATGCCTTGTGGCAACTGCTCCTACTGTTCAAAGgtaatactgt ... tggtatacagGGCCATGATGATCTATGTGAAGCTTTCTTTGCCTATAACCGGGCAAAAGGA
EST: gi|208192364|gb|GD993740.1|GD993740
EST:     TTGTTGGGGCCTTCATCATGCCTTGTGGCAACTGCTCCTACTGTTCAAAG                         GGCCATGATGATCTATGTGAAGCTTTCTTTGCCTATAACCGGGCAAAAGG
genomic: TTGTTGGGGCCTTCATCATGCCTTGTGGCAACTGCTCCTACTGTTCAAAGgtaatactgt ... tggtatacagGGCCATGATGATCTATGTGAAGCTTTCTTTGCCTATAACCGGGCAAAAGG
EST: gi|298164571|gb|HO014216.1|HO014216
EST:     TTGTTGGGGCCTTCATCATGCCTTGTGGCAACTGCTCCTACTGTTCAAAG                         GGCCATGATGATCTATGTGAAGCTTTCTTTGCCTATAACCGGGCAAAAGGA
genomic: TTGTTGGGGCCTTCATCATGCCTTGTGGCAACTGCTCCTACTGTTCAAAGgtaatactgt ... tggtatacagGGCCATGATGATCTATGTGAAGCTTTCTTTGCCTATAACCGGGCAAAAGGA
EST: gi|151395988|gb|EV265865.1|EV265865
EST:     TTGTTGGGGCCTTCATCATGCCTTGTGGCAACTGCTCCTACTGTTCAAAG                         GGCCATGATGATCTATGTGAAGCTTTCTTTGCCTATAACCGGGCAAAAGGA
genomic: TTGTTGGGGCCTTCATCATGCCTTGTGGCAACTGCTCCTACTGTTCAAAGgtaatactgt ... tggtatacagGGCCATGATGATCTATGTGAAGCTTTCTTTGCCTATAACCGGGCAAAAGGA