Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CTTTGGAAGAGATTCAGGGGAGATGACAAGCCTCCTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAGgtcttattatttatttgtttttattttattatattttggtatactaaatctggatgcatatgatatgattctcaatttgtgtaacattattatttaatgatttgttttcttctag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA05G30140.1
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|192322711|gb|FK014402.1|FK014402
EST:     CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAG                         TTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
genomic: CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAGgtcttattat ... tttcttctagTTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
EST: gi|193659253|gb|FK605052.1|FK605052
EST:     CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAG                         TTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
genomic: CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAGgtcttattat ... tttcttctagTTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
EST: gi|213598704|gb|DB964270.1|DB964270
EST:     CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAG                         TTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
genomic: CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAGgtcttattat ... tttcttctagTTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
EST: gi|17021940|gb|BM092974.1|BM092974
EST:     CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAG                         TTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
genomic: CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAGgtcttattat ... tttcttctagTTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
EST: gi|213593669|gb|DB971691.1|DB971691
EST:     CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAG                         TTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
genomic: CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAGgtcttattat ... tttcttctagTTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
EST: gi|193325776|gb|FK290215.1|FK290215
EST:     CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAG                         TTTTATTTATTGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATA
genomic: CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAGgtcttattat ... tttcttctagTTT-ATT-AT-GGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATA
EST: gi|213590255|gb|DB963832.1|DB963832
EST:     CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAG                         TTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
genomic: CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAGgtcttattat ... tttcttctagTTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
EST: gi|151400876|gb|EV270690.1|EV270690
EST:     CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAG                         TTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
genomic: CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAGgtcttattat ... tttcttctagTTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
EST: gi|209722563|gb|BW682662.1|BW682662
EST:     CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAG                         TTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
genomic: CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAGgtcttattat ... tttcttctagTTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
EST: gi|17964174|gb|BM270913.1|BM270913
EST:     CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAG                         TTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
genomic: CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAGgtcttattat ... tttcttctagTTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
EST: gi|7924853|gb|AW830879.1|AW830879
EST:     CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAG                         TTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
genomic: CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAGgtcttattat ... tttcttctagTTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
EST: gi|213603679|gb|DB966807.1|DB966807
EST:     CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAG                         TTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
genomic: CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAGgtcttattat ... tttcttctagTTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
EST: gi|207770456|gb|GD744170.1|GD744170
EST:     CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAG                         TTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
genomic: CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAGgtcttattat ... tttcttctagTTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
EST: gi|254342789|gb|GR858951.1|GR858951
EST:     CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAG                         TTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
genomic: CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAGgtcttattat ... tttcttctagTTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
EST: gi|209710882|gb|BW653643.1|BW653643
EST:     CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAG                         TTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
genomic: CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAGgtcttattat ... tttcttctagTTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
EST: gi|151400851|gb|EV270665.1|EV270665
EST:     CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAG                         TTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
genomic: CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAGgtcttattat ... tttcttctagTTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
EST: gi|213595671|gb|DB972141.1|DB972141
EST:     CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAG                         TTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT
genomic: CTCCACATTTGGGCGCTAGCAGGGACTACAACATCGATATGAACCCCAAGgtcttattat ... tttcttctagTTTATTATGGCTAATGGCAATTTGGTGCGGGTTCTCATACATACCGATGTT